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Dong-Hyun Kim (Kyungpook National University) Kook-Il Han (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Hae Jun Kwon (Kyungpook National University) Mi Gyeong Kim (Kyungpook National University) Young Guk Kim (Kyungpook National University) Doo Ho Choi (Kyungpook National University) Keun Chul Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Min Kuk Suh (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Han Sol Kim (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Jung-Sook Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Jong-Guk Kim (Kyungpook National University)
저널정보
한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 제55권 제3호
발행연도
2019.9
수록면
309 - 312 (4page)

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본 연구에서는 폐수처리장의 바이오필터로부터 Comamonas sp. NLF-7-7 균주를 분리하고 유전체서열을 PacBio RS II와 Illumina HiSeqXten 플랫폼을 사용하여 분석하였다. 염색체의 크기는 3,333,437 bp로 G + C 구성 비율은 68.04%, 총 유전자수는 3,197개, rRNA는 9개 및 tRNA는 49개로 구성되었다. 본 유전체는 오염물질분해와 플록형성에 관여하는 황산화 경로 유전자(SoxY, SoxZ, SoxA 및 SoxB)와 플록형성 경로 유전자(EpsG, EpsE, EpsF, EpsG, EpsL 및 glycosyltransferase)를 포함하고 있다. 이러한 Comamonas sp. NLF-7-7 균주는 폐수를 정화하는데 활용될 수 있다.
#Comamonas sp. NLF-7-7 #Illumina HiSeqXten #PacBio RS II #wastewater

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Anandham R / 2008 / Chemolithoautotrophic oxidation of thiosulfate and phylogenetic distribution of sulfur oxidation gene(soxB)in rhizobacteria isolated from crop plants / Res. Microbiol 159:579~589 google schola Camacho C / 2009 / BLAST+ : architecture and applications / BMC Bioinformatics 10:421 google schola Chin CS / 2013 / Nonhybrid, finished microbial genome assemblies from long-read SMRT sequencing data / Nat. Methods 10:563~569 google schola De Vos P / 1985 / Comamonas Davis and Park 1962, gen. nov., nom. rev. emend., and Comamonas terrigena Hugh 1962, sp. nov., nom. rev / Int. J. Syst. Bacteriol 35:443~453 google schola Huerta-Cepas J / 2016 / eggNOG 4.5: a hierarchical orthology framework with improved functional annotations for eukaryotic, prokaryotic and viral sequences / Nucleic Acids Res 44:D286~293 google schola

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