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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 발행연도
- 2019.1
- 수록면
- 93 - 101 (9page)
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개(Canis lupus familiaris)는 인간의 소외 현상을 개선하고, 공동체 생활 의식 향상에 기여하는 반려동물이다. 반려견 품종을 명확히 관리하는 것은 유전병을 감소시키거나, 형질 개량, 종 다양성 유지등을 위해 중요하다. 본 연구에서는 고밀도 SNP 칩 유전자형 데이터와 기계학습 기술을 이용하여, 유전자형 데이터에 기반한 품종 식별이 가능한지, 가능하다면 최소 몇 개의 유전마커로 품종 식별을 유의하게 수행할 수 있는지 확인하기 위하여, 반려견 11 품종 226두의 23K SNP 칩 데이터를 분석하였다. 9종의 기계학습 다중범주 분류 알고리즘과 2종의 특징 선택 방법의 성능을 비교하여, 선형 서포트벡터 머신 분류기와 주성분 분석 특징 기여도를 이용한 특징 선택 방법을 이용했을 때, 11종의 반려견품종을 90% 이상 정확도로 식별하였으며, 이 때 40개의 유전마커가 필요함을 확인하였다. 최종 선발된 40개의 반려견 품종 식별 유전마커는 타 질병 예측 마커와 결합하여 유전자 검사 키트로 제작될수 있으며, 반려견 품종 관리 및 질병 관리 기술로 유용하게 활용될 수 있을 것이다.
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참고문헌 (21)
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Berger B / 2018 / Dog breed affiliation with a forensically validated canine STR set / Forensic Sci. Int. Genet 37:126~134
Breiman LJMl / 2001 / Random forests / Mach. Learn 45:5~32
Carlson CS / 2004 / Selecting a maximally informative set of single-nucleotide polymorphisms for association analyses using linkage disequilibrium / Am. J. Hum Genet 74:106~120
Chen S / 1991 / Orthogonal least squares learning algorithm for radial basis function networks / IEEE Trans Neural Netw 2:302~309
Freund Y / 1997 / A decision-theoretic generalization of on-line learning and an application to boosting / J. Comput. Syst. Sci 55:119~139
Breiman LJMl / 2001 / Random forests / Mach. Learn 45:5~32
Carlson CS / 2004 / Selecting a maximally informative set of single-nucleotide polymorphisms for association analyses using linkage disequilibrium / Am. J. Hum Genet 74:106~120
Chen S / 1991 / Orthogonal least squares learning algorithm for radial basis function networks / IEEE Trans Neural Netw 2:302~309
Freund Y / 1997 / A decision-theoretic generalization of on-line learning and an application to boosting / J. Comput. Syst. Sci 55:119~139
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