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논문 기본 정보

자료유형
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저자정보
저널정보
한국미생물생명공학회 Journal of Microbiology and Biotechnology Journal of Microbiology and Biotechnology 제20권 제11호
발행연도
2010.1
수록면
1,500 - 1,505 (6page)

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The novel swine-origin influenza A/H1N1 virus (S-OIV)first detected in April 2009 has been identified to transmit from humans to humans directly and is the cause of the currently emerged pandemic. In this study, nucleotide and deduced amino acid sequences of the hemagglutinin (HA)and neuraminidase (NA) of the S-OIV and other influenza A viruses were analyzed through bioinformatic tools for phylogenetic analysis, genetic recombination, and point mutation to investigate the emergence and adaptation of the S-OIV in humans. The phylogenetic analysis showed that the HA comes from triple reassortant influenza A/H1N2 and the NA from Eurasian swine influenza A/H1N1,indicating that HA and NA descend from different lineages during the genesis of the S-OIV. Recombination analysis nullified the possibility of occurrence of recombination in HA and NA, denoting the role of reassortment in the outbreak. Several conservative mutations were observed in the amino acid sequences of the HA and NA, and these mutated residues were identical in the S-OIV. The results reported herein suggest the notion that the recent pandemic is the result of reassortment of different genes from different lineages of two envelope proteins, HA and NA, which are responsible for the antigenic activity of the virus. This study further suggests that the adaptive capability of the S-OIV in humans is acquired by the unique mutations generated during emergence.
#Hemagglutinin #influenza A/H1N1 #mutation #neuraminidase #reassortment #S-OIV

목차

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Boni, M. F / 2008 / Homologous recombination is very rare or absent in human influenza A virus / J. Virol 82 : 4807 ~ 4811 google schola Clamp, M / 2004 / The Jalview Java alignment editor / Bioinformatics 20 : 426 ~ 427 google schola Ding, N / 2009 / Molecular evolution of novel swine-origin A/H1N1 influenza viruses among and before human / Virus Genes 39 : 293 ~ 300 google schola Etherington, G. J / 2005 / Recombination Analysis Tool (RAT): A program for the high-throughput detection of recombination / Bioinformatics 21 : 278 ~ 281 google schola Garten, R. J / 2009 / Antigenic and genetic characteristics of swine-origin 2009 A(H1N1) influenza viruses circulating in humans / Science 325 : 192 ~ 201 google schola

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