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논문 기본 정보

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저자정보
저널정보
한국미생물생명공학회 Journal of Microbiology and Biotechnology Journal of Microbiology and Biotechnology 제25권 제7호
발행연도
2015.1
수록면
1,136 - 1,145 (10page)

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The diverse microbial communities that colonize distinct segments of the gastrointestinal tract are intimately related to aspects of physiology and the pathology of human health. However, most recent studies have focused on the rectal or fecal microbiota, and the microbial signature of the duodenum is poorly studied. In this study, we compared the microbiota in duodenal and rectal samples to illustrate the characteristic microbial signatures of the duodenum in healthy adults. Nine healthy volunteers donated biopsies and luminal contents from the duodenum and rectum. To determine the composition and diversity of the microbiota, 454- pyrosequencing of bacterial 16S rRNA was performed and multiple bioinformatics analyses were applied. The α-diversity and phylogenetic diversity of the microbiota in the duodenal samples were higher than those of the rectal samples. There was higher biodiversity among the microbiota isolated from rectal biopsies than feces. Proteobacteria were more highly represented in the duodenum than in the rectum, both in the biopsies and in the luminal contents from the healthy volunteers (38.7% versus 12.5%, 33.2% versus 5.0%, respectively). Acinetobacter and Prevotella were dominant in the duodenum, whereas Bacteroides and Prevotella were dominant in the rectum. Additionally, the percentage of OTUs shared in biopsy groups was far higher than in the luminal group (43.0% versus 26.8%) and a greater number of genera was shared among the biopsies than the luminal contents. Duodenal samples demonstrated greater biological diversity and possessed a unique microbial signature compared with the rectum. The mucosa-associated microbiota was more relatively conserved than luminal samples.
#Microbiota #duodenum #rectum #biopsy #mucus #feces

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Arumugam M / 2011 / Enterotypes of the human gut microbiome / Nature 473 : 174 ~ 180 google schola Baba N / 2008 / Commensal bacteria trigger a full dendritic cell maturation program that promotes the expansion of non-Tr1 suppressor T cells / J. Leukoc. Biol 84 : 468 ~ 476 google schola Bohm M / 2013 / Diagnosis and management of small intestinal bacterial overgrowth / Nutr. Clin. Pract 28 : 289 ~ 299 google schola Brock TD / 1988 / Biology of Microorganisms / Prentice Hall : 42 ~ 59 google schola Brown CT / 2011 / Gut microbiome metagenomics analysis suggests a functional model for the development of autoimmunity for type 1 diabetes / PLoS One 6 : e25792 ~ google schola

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