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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국자료분석학회 Journal of The Korean Data Analysis Society Journal of The Korean Data Analysis Society 제9권 제1호
발행연도
2007.1
수록면
127 - 135 (9page)

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본 논문에서는 마이크로어레이 행렬자료에서 두 조직표본 계급에 걸쳐 대상 질환에 대해 유의적으로 상이발현 하는 양성 유전자집단과 음성 유전자 집단 및 그렇지 않은 비상이 발현 유전자 집단의 군집을 유도함에 있어 성분-평균에 선형계획을 도입한 정규혼합모형을 이용하였다. 특히 본 논문에서 강조한 점은 두 상이발현 유전자 군집에서 계급에 걸쳐 폴드 변이가 일정한 수준이 되도록 제약식을 두어 상이발현 유전자 집단이 보다 뚜렷한 정보를 가진 유전자들로 이루어지도록 한 것이다. 또한 상이 패턴 혹은 비상이 패턴 외에 특성을 가지는 유전자를 또 하나의 군집으로 흡수하기 위해 균등분포를 혼합모형의 성분으로 추가하였다. 이 과정에서 EM 알고리즘을 이용한 모형 적합을 유도하였다. 그리고 Alon의 대장암 마이크로어레이 발현자료를 사용하여 거짓양성 유전자에 관련하여 제안된 군집기법의 유효성을 실험하였다.
#마이크로어레이 #유전자 군집 #폴드변이 제약 #정규혼합모형 #EM 알고리즘. #microarray data #gene clustering #restriction of fold change #mixture model #EM algorithm.

목차

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참고문헌 (9)

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Alon, U. / 1999 / Broad patterns of gene expression revealed by clustering analysis of tomor and normal colon tissues probed by oligonucleotide arrays / Proceedings of the National google schola McLachlan, G. J. / 2002 / A mixture model-based approach to the clustering of micorarray expression data / Bioinformatics 18 : 413 ~ 422 google schola McLachlan, G. J. / 2004 / Analyzing Microarray Gene Expression Data / Wiely and Sons google schola Seung-Gu Kim / 2006 / Use of Factor Analyzer Normal Mixture Model with Mean Pattern Modeling on Clustering Genes / Communications for Statistical Applications and Methods 13 google schola Storey, J. D. / 2003 / Statistical significance for genome-wide studies / Proceeding of the National Academy of Sciences USA 100 : 9440 ~ 9445 google schola

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