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논문 기본 정보

자료유형
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저자정보
저널정보
대한병리학회 Journal of Pathology and Translational Medicine Journal of Pathology and Translational Medicine 제43권 제3호
발행연도
2009.1
수록면
250 - 253 (4page)

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Background : HPV-other samples are designated as being positive on HPV-PCR, but negative when using specific HPV hybridization probes. We wanted to determine the types on the HPV-other samples by performing sequencing, and to know the pathologic status of the uterine cervix according to the HPV type detected on sequencing. Methods : For HPV genotying, we used the commercially available HPV DNA Chip test, which contains 15 types of highrisk HPV and 9 types of low-risk HPV. The HPV DNA sequencing was performed for the HPVother samples of 209 patients who subsequently underwent cervical biopsy. Results : For 204 of the 209 samples, the HPV types detected by sequencing were absent types at used HPV DNA chip. For the remaining 5 samples, sequencing was impossible due to mixed peaks. HPV-81 (19.6%), HPV-61 (18.6%), HPV-62 (16.7%) and HPV-84 (13.9%) were frequently detected. For the HPV-81, -62, -71, and -72 samples, most of the samples displayed normal or LSIL. However, HPV-84 and -61 were more associated with HSIL or worse, as compared to the other types. Conclusion : HPV-81, -61, -62 and -84 were frequently found on sequencing analysis of the HPV-other samples. The pathologic status was diverse, according to the HPV type detected on sequencing.
#DNA chips #Papillomaviridae #Sequence analysis #Uterine cervix

목차

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An HJ / 2003 / Correlation of cervical carcinoma and precancerous lesions with human papillomavirus (HPV) genotypes detected with the HPV DNA chip microarray method / Cancer google schola Broker TR / 2001 / Croom-Rivers A, et al. Viral latency-The papillomavirus model / Dev Biol 106 : 443 ~ 451 google schola Chan SY / 1995 / Analysis of genomic sequences of 95 papillomavirus types: uniting typing, phylogeny, and taxonomy / J Virol 69 : 3074 ~ 3083 google schola Choi YD / 2005 / Detection of HPV genotypes in cervical lesions by the HPV DNA Chip and sequencing / Gynecol Oncol 98 : 369 ~ 375 google schola Clifford GM / 2005 / Human papillomavirus genotype distribution in low-grade cervical lesions: comparison by geographic region and with cervical cancer / Cancer Epidemiol Bi google schola

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