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이 논문의 연구 히스토리 (2)
2019
Complete genome sequence of Pantoea intestinalis SRCM103226, a microbial C40 carotenoid zeaxanthin producer
Jin Won Kim
,
Gwangsu Ha
,
Seong-Yeop Jeong
외 1명
미생물학회지
2019.06
학술저널
Complete Genome Sequence of Pantoea intestinalis SRCM103226, a Microbial C40 Carotenoid Zeaxanthin Producer
Jin Won Kim
,
Gwang-su Ha
,
HoYeon Yang
외 5명
한국미생물학회 학술대회논문집
2019.04
학술대회자료
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Pantoea intestinalis SRCM103226은 식용곤충 밀웜으로부터 분리하였으며, zeaxanthin을 메인으로 생산하였다. P. intestinalis SRCM103226의 유전체 분석을 실시하여 4,784,919 bp 크기의 염기서열, GC 비율은 53.41%로 나타났으며, 플라스미드는 존재하지 않는다. RAST server를 이용하여 annotation한 결과 4,332개의 코딩유전자, 22개의 rRNA, 85개의 tRNA 유전자가 확인되었다 지놈분석결과 zeaxanthin 생합성회로 5개 유전자를 가지고 있다. 이러한 유전체 정보는 zeaxanthin 생합성경로의 분자 진화의 비교 유전체학 연구에 대한 기초 정보를 제공한다.
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참고문헌 (21)
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Albermann C. 2011. High versus low level expression of the lycopene biosynthesis genes from Pantoea ananatis in Escherichia coli. Biotechnol. Lett. 33, 313?319.
Aziz RK, Bartels D, Best AA, DeJongh M, Disz T, Edwards RA, Formsma K, Gerdes S, Glass EM, and Kubal M. 2008. The RAST server: rapid annotations using subsystems technology. BMC Genomics 9, 75.
Delcher AL, Harmon D, Kasif S, White O, and Salzberg SL. 1999. Improved microbial gene identification with GLIMMER. Nucleic Acids Res. 27, 4636?4641.
Holt NE, Zigmantas D, Valkunas L, Li XP, Niyogi KK, and Fleming GR. 2005. Carotenoid cation formation and the regulation of photosynthetic light harvesting. Science 307, 433?436.
Hunt M, Silva ND, Otto TD, Parkhill J, Keane JA, and Harris SR. 2015. Circlator: automated circularization of genome assemblies using long sequencing reads. Genome Biol. 16, 294.
Aziz RK, Bartels D, Best AA, DeJongh M, Disz T, Edwards RA, Formsma K, Gerdes S, Glass EM, and Kubal M. 2008. The RAST server: rapid annotations using subsystems technology. BMC Genomics 9, 75.
Delcher AL, Harmon D, Kasif S, White O, and Salzberg SL. 1999. Improved microbial gene identification with GLIMMER. Nucleic Acids Res. 27, 4636?4641.
Holt NE, Zigmantas D, Valkunas L, Li XP, Niyogi KK, and Fleming GR. 2005. Carotenoid cation formation and the regulation of photosynthetic light harvesting. Science 307, 433?436.
Hunt M, Silva ND, Otto TD, Parkhill J, Keane JA, and Harris SR. 2015. Circlator: automated circularization of genome assemblies using long sequencing reads. Genome Biol. 16, 294.
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