유전자 행렬 맵핑을 활용한 우수 유전자형 조합 선별

이제영; 이종형; 이용원

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자료유형: 학술저널

저자정보: 이제영 이종형 이용원

저널정보: 한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 한국데이터정보과학회지 제21권 제3호

발행연도: 2010.6

수록면: 387 - 395 (9page)

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인간의 질병 및 가축의 특성치에 관한 유전자 규명은 매우 중요한 과제이다. 유전자원 보존과 유전능력향상을 위한 기술 개발 역시 매우 중요한 관심사로써 이와 관련된 많은 연구들을 진행해왔다. 통계모형의 상호작용 효과를 분석하기 위해 로지스틱 회귀분석과 같은 전통적인 방법과 비모수적인 방법들이 개발되었지만 이들은 상호작용에 영향을 준 양적형질위치들의 하위 집단의 유전자형에 대해서 고려하지 않은 문제점이 있다. 따라서 많은 양적형질위치들을 한 번에 비교하여 특성치에 영향을 주는 양적형질위치의 상호작용과 그 하위집단인 유전자형을 규명하는 방법으로 유전자형 행렬 맵핑이 개발되었다. 본 연구에서는 EST<sub>B</sub>ased SNP 연관지도에 의해 선정된 17개의 후보 단일염기다형성을 대상으로 유전자 행렬 맵핑을 활용하여 한우의 주요 경제형질인 일당증체량, 도체중, 등심단면적, 근내지방도에 영향을 주는 우수 유전자형 조합을 선별한다. 그리고 선별된 조합에 대해 유전자 행렬 맵핑 방법에서 적용되지 않은 순열검정을 도입함으로써 우수유전자형 조합에 대한 통계적인 유의성을 확인한다.

#단일염기다형성 #hanwoo Economic traits #SNP(single nucleotide polymorphisms) #유전자 행렬 맵핑 #한우 경제형질 #GMM(genotype matrix mapping)

참고문헌 (9)

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1. [학술대회논문] - Chung, Y. J. / 2005 / Multifactor dimensionality reduction in the presence of missing observations / Proceedings of the Autumn Conference : 31 ~ 36

2. [단행본] - Efron, B. / 1993 / An introduction to the bootstrap / Champman & Hall/CRC

3. [단행본] - Good, P. / 2000 / Permutation test: A ractical guide to resampling method for testing hypotheses / Springer-Verlag Berlin and Heidelberg GmbH & Co.

4. [학술지(정기간행물)] - Jea-Young Lee / 2008 / Multifactor Dimensionality Reduction (MDR) Analysis to Detect Single Nucleotide Polymorphisms Associated with a Carcass Trait in a Hanwoo Population / ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES 21 (6) : 784 ~ 788

5. [학술지(정기간행물)] - 이제영 / 2009 / 더미(dummy) 변수를 활용한 다중인자 차원 축소(MDR) 방법 / 응용통계연구 22 (2) : 435 ~ 442

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