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저자정보
왕세희 (아주대학교) 위규범 (아주대학교)
저널정보
한국컴퓨터정보학회 한국컴퓨터정보학회 학술발표논문집 2016년 한국컴퓨터정보학회 하계학술대회 논문집 제24권 제2호
발행연도
2016.7
수록면
21 - 24 (4page)

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전장유전체 연관성 연구에서 상위성 탐색은 많은 단일염기다형성 수로 인해 계산이 어렵기 때문에 네트워크에서의 탐색을 이용한 방법이 사용되고 있다. 그러나 전장유전체 연관성 연구에서 단일염기다형성들의 상위성 네트워크의 구성 역시 큰 계산 비용을 필요로 한다. 본 논문에서는 단일염기다형성과 표현형의 상호정보량을 이용한 네트워크를 구성하는데 드는 시간을 줄이는 알고리즘을 제안한다. 또한 표본 크기별로 계산 시간을 실험해 보았으며, 기존의 방법과 비교해 실행 속도가 향상됨을 보였다.
#전장유전체 연관성 연구(genome-wide association study) #단일염기다형성(single nucleotide polymorphism) #상위성(epistasis) #상호정보량(mutual information) #분할표(contingency table)

목차

요약
I. Introduction
II. Preliminaries
III. The Proposed Algorithm
IV. Conclusions
References

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