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세균 16S rRNA 유전자 염기서열은 분자계통분류, 진화역사 규명, 미생물 검출 등 다양한 목적으로 이용되어 왔다. 세균 제놈(genome)은 multiple rRNA 오페론을 갖고 있으며, 이들 유전자 염기서열은 일부 변이가 있는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 Vibrio 속의 16S rRNA 유전자 염기서열을 이용하여 세포 내 16S rRNA의 이질성을 규명하였다. 분석은 GenBank 자료 중에서 제놈 염기서열 annotation이 완료된 V. cholerae, V. harveyi, V. parahaemolyticus, V. splendidus, V. vulnificus를 이용하여 실시하였다. Vibrio 속은 1번 염색체에 7~10개의 16S rRNA 유전자 copy를 갖고 있으며, 이들의 세포 내 유전자 변이는 0.9% 이하 상이성(99.1%이상 DNA 상동성)을 보였다. 2번 염색체에서는 16S rRNA 유전자가 1개 이하로 존재하였다. 유전체내 16S rRNA 유전형은 최소 5개(V.vulnificus #CMCP6)에서 최대 8개(V. parahaemolyticus #RIMD 2210633, V. harveyi #ATCC BAA-1116)로 조사되었다. 본 결과는 Vibrio 속의 16S rRNA 유전자 염기서열이 높은 이질성을 갖는 것을 제시해 준다.
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1. [학술지(정기간행물)] - 안순철 / 2007 / Vibrio tapetis의 검출을 위한 PCR specific primer의 제작 / 생명과학회지 17 (2) : 162 ~ 165
2. [학술지(정기간행물)] - 윤영준 / 2000 / 수입냉동 어패류에 오염되어 있는 Vibrio 속 세균의 분리 및 동정 / J. Fd Hyg. Safety 15 : 128 ~ 136
3. [학술지(정기간행물)] - Acinas, S.G. / 2004 / Divergence and redundancy of 16S rRNA sequences in genomes with multiple rrn operons / J. Bacteriol. 186 : 2629 ~ 2635
4. [학술지(정기간행물)] - Case, R.J. / 2007 / Use of 16S rRNA and rpoB genes as molecular markers for microbial ecology studies / Appl. Environ. Microbiol. 73 : 278 ~ 288
5. [학술지(정기간행물)] - Coenye, T / 2003 / Intragenomic heterogeneity between multiple 16S ribosomal RNA operons in sequenced bacterial genomes / FEMS Microbiol. Lett. 228 : 45 ~ 49
2. [학술지(정기간행물)] - 윤영준 / 2000 / 수입냉동 어패류에 오염되어 있는 Vibrio 속 세균의 분리 및 동정 / J. Fd Hyg. Safety 15 : 128 ~ 136
3. [학술지(정기간행물)] - Acinas, S.G. / 2004 / Divergence and redundancy of 16S rRNA sequences in genomes with multiple rrn operons / J. Bacteriol. 186 : 2629 ~ 2635
4. [학술지(정기간행물)] - Case, R.J. / 2007 / Use of 16S rRNA and rpoB genes as molecular markers for microbial ecology studies / Appl. Environ. Microbiol. 73 : 278 ~ 288
5. [학술지(정기간행물)] - Coenye, T / 2003 / Intragenomic heterogeneity between multiple 16S ribosomal RNA operons in sequenced bacterial genomes / FEMS Microbiol. Lett. 228 : 45 ~ 49
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