메타프로테오믹스의 미생물생태학적 응용

김종식; 우정희; 김준태; 박년호; 김충곤

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저자정보: 김종식 (경북해양바이오산업연구원) 우정희 (경북해양바이오산업연구원) 김준태 (경북해양바이오산업연구원) 박년호 (경북해양바이오산업연구원) 김충곤 (경북해양바이오산업연구원)

저널정보: 한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 46권 1호

발행연도: 2010.3

수록면: 1 - 8 (8page)

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미생물 군집과 기능연구를 위한 최근의 새로운 분석기술의 발전은 다양한 유전 관련 정보를 제공해왔다. mRNA를 포함하는 핵산을 기초로 한 연구를 뛰어넘어서 메타프로테오믹스는 미생물 군집의 유전형 및 표현형의 특징적인 정보를 보다 정교하게 제공할 수 있다. 이미 서로 다른 미생물 생태계인 해수, 인간의 배설물, 활성 슬러지, 산성 광산 폐수 생물막, 토양 등에 메타프로테오믹스 기술이 유용하게 사용되었다. 이들 연구는 여러 측면에서 상당히 다르지만 미생물 군집의 구조, 기능, 생리, 상호관계, 생태, 진화적 측면을 결정적으로 상호 연결한다는 것을 밝혀냈다. 본 총설은 메타프로테오믹스에 대한 현재까지의 가장 최신의 정보를 요약하여 제공함으로써 메타프로테오믹스에 대한 정확한 이해와 활용을 통해 다방면의 메타프로테오믹스가 가능하도록 하고자 하였다.

#mass spectrometry #metaproteomics #microbial community #shot-gun analysis

참고문헌 (44)

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1. [학술지(정기간행물)] - Abram, F. / 2009 / Optimisation of protein extraction and 2-DE for metaproteomics of microbial communities from anaerobic wastewater treatment biofilms / Electrophoresis 30 : 4149 ~ 4151

2. [학술지(정기간행물)] - Apajalahti, J.H.A. / 2001 / Percent G+C profiling accurately reveals dietrelated differences in the gastrointestinal microbial community of broiler chickens / Appl. Environ. Microbiol 67 : 5656 ~ 5667

3. [학술지(정기간행물)] - Benndorf, D. / 2007 / Functional metaproteome analysis of protein extracts from contaminated soil and groundwater / ISME J. 1 : 224 ~ 234

4. [학술지(정기간행물)] - Benndorf, D. / 2009 / Improving protein extraction and separation methods for investigating the metaproteome of anaerobic benzene communities within sediments / Biodegradation 20 : 737 ~ 750

5. [학술지(정기간행물)] - Cardenas, E. / 2008 / New tools for discovering and characterizing microbial diversity / Curr. Opin. Biotechnol 19 : 544 ~ 549

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