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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
박민서 (Samsung) 김판규 (Samsung)
저널정보
Korean Institute of Information Scientists and Engineers 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 제38권 제10호
발행연도
2011.10
수록면
503 - 511 (9page)

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차세대 시퀀싱 기술은 전통적인 Sanger시퀀싱 방법보다 저렴한 비용과 빠른 데이터 생산 속도 등의 장점을 이용하여 빠르게 발전되었다. 현재 많이 사용되는 차세대 시퀀싱 기술 방식은 Roche의 GS-FLX, Illumina (Solexa)의 Genome Analyzer, Life Technologies의 SOLiD방식이다. 차세대 시퀀싱 기술 방식을 통해서 생산된 단편서열들은 Sanger시퀀싱을 통해서 생산되는 서열에 비해서 그 길이가 짧고, 대량의 단편서열을 사용하기 때문에, 서열 재조합시 참조 서열을 이용한 맵핑이 활용된다. 다량의 짧은 서열의 빠른 처리를 위해 인덱싱 기반의 휴리스틱 알고리즘들이 개발되어 사용되고 있다. 이러한 방법으로는 해쉬 테이블에 기반한 방법, 접미사 트리에 기반한 방법, 접미사 배열의 변형된 형태인 Burrows-Wheeler transform 에 기반한 방법이 있다. 이 논문에서는 현재 개발된 서열 정렬 알고리즘들을 살펴보고, 다양한 차세대 시퀀싱 맵핑 프로그램들을 소개한다.
#차세대 시퀀싱 #서열 정렬 알고리즘 #차세대 시퀀싱 맵핑 프로그램 #서열 재조합 #인덱싱 #Next-Generation Sequencing #Alignement Algorithm #NGS mappping program #Resequencing #Indexing

목차

요약
Abstract
1. 서론
2. 정렬알고리즘(Alignment Algorithms)
3. NGS 맵핑 프로그램
4. 결론
참고문헌

참고문헌 (20)

참고문헌 신청
1. [학술지(정기간행물)] - D. Bentley / 2006 / Whole-genome re-sequencing / Current Opinion in Genetics & Development 16 (6) : 545 ~ 552 google schola 2. [인터넷자원] - Life Sciences (Roche Diagnostics) / / GS FLX google schola 3. [인터넷자원] - Illumina (Solexa) / / Genome Analyzer google schola 4. [인터넷자원] - Life Technologies / / SOLiD google schola 5. [학술지(정기간행물)] - B. Ewing / 1998 / Base-Calling of Automated Sequencer Traces Using Phred. II. Error Probabilites / Genome Research 8 : 186 ~ 194 google schola

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