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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 저널정보
- Korean Institute of Information Scientists and Engineers 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 제36권 제11호
- 발행연도
- 2009.11
- 수록면
- 875 - 890 (16page)
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대사체학은 대사 경로 네트워크를 통해 생명 활동을 이해하고자 하는 분야로서, 대사 경로 내의 흐름을 한 눈에 알 수 있도록 가시화하여 보여 주는 도구가 반드시 필요하다. 이러한 가시화 도구의 경우 노드수가 증가할수록 에지 교차가 기하급수적으로 증가하는 문제가 있다. 따라서 유전체 수준의 대사경로를 연구하기 위해서는 대사 경로 그래프 레이아웃 상에 나타나는 에지 교차를 줄이는 것이 시각화의 매우 중요한 부분이다.
본 논문에서는 대사 경로의 구조적인 특징에 기반한 3차원 공간 상에 대사 경로 그래프를 레이아웃해 주는 모듈을 설계, 구현하였다. 2-계층 레이아웃을 이용하여 대사 경로 그래프를 계층적으로 레이아웃함으로써 표현영역을 3차원으로 확장시키고 기존의 2차원 레이아웃 알고리즘 적용시 빈번히 나타나는 에지 교차의 수를 감소시키는 결과를 얻었다.
본 논문에서는 대사 경로의 구조적인 특징에 기반한 3차원 공간 상에 대사 경로 그래프를 레이아웃해 주는 모듈을 설계, 구현하였다. 2-계층 레이아웃을 이용하여 대사 경로 그래프를 계층적으로 레이아웃함으로써 표현영역을 3차원으로 확장시키고 기존의 2차원 레이아웃 알고리즘 적용시 빈번히 나타나는 에지 교차의 수를 감소시키는 결과를 얻었다.
목차
요약
Abstract
1. 서론
2. 기존 연구
3. 2-계층 레이아웃(2-Layered layout)을 이용한 2.5차원 대사 경로 레이아웃 모듈
4. 실험 및 실험 결과
5. 결론 및 향후 연구과제
참고문헌
참고문헌 (12)
참고문헌 신청
1. [학술대회논문] - Y. Deville / 2003 / An Overview of Data Models for the Analysis of Biochemical Pathways / Proceedings of International Workshop on Computational Methods in System Biology : 174 ~
2. [학술지(정기간행물)] - P. D. Karp / 2002 / The EcoCyc Database / Nucleic Acids Reasearch 30 (1) : 56 ~ 58
3. [학술지(정기간행물)] - M. Y. Becker / 2001 / A Graph Layout Algorithm for Drawing Metabolic Pathways / BIOINFORMATICS 17 (5) : 461 ~ 467
4. [학술대회논문] - Y. Yang / 2006 / Hierarchical Visualization of Metabolic Networks using Virtual Reality / Proceedings of the 2006 ACM international conference on Virtual reality continuum and its applications : 377 ~ 381
5. [학술지(정기간행물)] - I. Rojdestvenski / 2003 / Metabolic pathways in three dimensions / BIOINFORMATICS 19 (18) : 2436 ~ 2441
2. [학술지(정기간행물)] - P. D. Karp / 2002 / The EcoCyc Database / Nucleic Acids Reasearch 30 (1) : 56 ~ 58
3. [학술지(정기간행물)] - M. Y. Becker / 2001 / A Graph Layout Algorithm for Drawing Metabolic Pathways / BIOINFORMATICS 17 (5) : 461 ~ 467
4. [학술대회논문] - Y. Yang / 2006 / Hierarchical Visualization of Metabolic Networks using Virtual Reality / Proceedings of the 2006 ACM international conference on Virtual reality continuum and its applications : 377 ~ 381
5. [학술지(정기간행물)] - I. Rojdestvenski / 2003 / Metabolic pathways in three dimensions / BIOINFORMATICS 19 (18) : 2436 ~ 2441
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