Identification of novel protein factors for progression in renal cell carcinoma based on global proteomics :포괄적 단백질체학을 이용한 신세포암의 진행에 관여하는 새로운 단백질 인자 규명

박주희

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자료유형: 학위논문

저자정보: 박주희 (경북대학교, 경북대학교 대학원)

지도교수: 배종섭

발행연도: 2023

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2023

Identification of novel protein factors for progression in renal cell carcinoma based on global proteomics

박주희 약학과 2023.01 학위논문

2022

Identification of potential biomarker in renal cell carcinoma through global proteomics

박주희 , 나안예 , 심현채 외 2명 환경독성보건학회 심포지엄 및 학술대회 2022.05 학술대회자료

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신세포암(RCC)은 전 세계적으로 흔하게 진단되는 암으로 안타깝게도 상당수의 환자(약 25~30%)가 초기 진단 시 이미 전이가 진행된 것으로 보고되고 있다. 이는 낮은 5년 생존율에서 알 수 있듯이 전이성 신세포암(mRCC) 환자의 예후가 좋지 않으므로 신세포암의 예측과 예후에 도움이 될 수 있는 인자를 탐색하는 것이 필요하다. 본 연구는 질량 분석 기반 단백질체학을 사용하여 초기부터 전이까지 다양한 단계의 신세포암 진단을 받은 환자로부터 얻은 투명세포 신세포암(ccRCC) 조직에 존재하는 새로운 인자를 탐색하였다. 각각 총 2,608개가 확인되었고, 그 중 2,463개의 단백질이 정량되었으며, 정량된 단백질 중 1,449개의 단백질이 차별적으로 발현되는 것을 확인하였다. Bioinformatics 분석을 통해 표적 단백질로 SERPINA3를 선정하고, 간접효소결합면역흡착분석법(간접 ELISA), 면역블로팅법 (immunoblotting), 면역조직화학(IHC) 분석법을 이용해 투명세포 신세포암 조직에서 SERPINA3의 선택적 발현을 확인하였다. 결과적으로, SERPINA3 발현이 초기 단계보다 전이성 신세포암에서 유의하게 높았고, 이는 SERPINA3가 투명세포 신세포암의 진행에 관여할 수 있음을 시사한다.

#Cancer

Ⅰ. Introduction 1
Ⅱ. Materials and Methods 4
1. Clinical tissue samples of patients with kidney cancer 4
2. Sample preparation for comparative proteome analysis 4
3. Peptide fractionation by high-pH reverse-phase and desalting 6
4. NanoLC-MS/MS 7
5. Database searching 8
6. Bioinformatics 9
7. Immunoblotting 10
8. Indirect enzyme-linked immunosorbent assay 11
9. Immunohistochemistry 12
10. Statistics 12
Ⅲ. Results 13
1. Comparative proteomics analysis of ccRCC tissue 13
2. Identification of DEPs in mRCC 18
3. Verification of DEPs in clinical tissue 29
Ⅳ. Discussion 34
Ⅴ. References 38
Korean abstract 42

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