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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학위논문
- 저자정보
- 지도교수
- 이진호
- 발행연도
- 2022
- 저작권
- 연세대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.
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현대 과학과 의학의 기초가 되는 게놈 analysis는 게놈 assembly 과정 중에서도 sequence alignment에서 병목지점을 갖고 있다. 이를 해결하기 위한 많은 연구가 진행되었고 많은 알고리즘이 개발되었는데 그 중에서도 BWT-SW는 Dynamic Programming을 이용하여 alignment를 수행하는 알고리즘이다. 본 연구에서는 BWT-SW를 thread pool을 활용해 병렬 처리하여 work load balance를 맞추면서 동기화 문제를 해결해 ×1.2~×2.5의 속도향상을 얻었다.
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