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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학위논문
- 저자정보
- 지도교수
- 김태성
- 발행연도
- 2018
- 저작권
- 한국방송통신대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.
이용수8
이 논문의 연구 히스토리 (4)
2018
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국화(Chrysanthemum morifolium)는 전세계적으로 주요 화훼작물 중 하나이며, 국내 화훼산업의 3대 작물에 속하지만, 최근 여러가지 요인으로 소비자의 기호 변화와 구매 욕구의 하락 요인으로 인해 농민들의 재배 의지가 위축되는 침체 위기에 직면해 있다. 이러한 국화 산업에 활력을 불어넣기 위해서, 혁신적인 국화 품종 개발을 위한 육종 기술과 국내에서 육성된 품종을 효율적으로 보호하는 품종보호체계가 절실히 필요하지만, 국화의 배수성 등 유전체의 복잡성 정도가 높아, 재현성이 높고 효과적인 분자 표지 마커 개발에 있어서 비용과 노력이 많이 드는 실정이다. 이를 위해 국내에서 유통되는 스탠다드 국화 ‘정운’과 ‘세이노이세이’ 품종을 기반으로 SSR(Simple Sequence Repeat) 서열을 cDNA library에서 대량동정 하고, 발굴된 SSR들 중 50개의 SSR을 대상으로 fianking region의 염기서열을 대상으로 프라이머를 디자인을 하여, 후보 SSR마커를 개발하였다.
개발된 SSR 마커 50개 중 PCR 증폭된 31개의 마커를 선발하였고, 활용성을 검증하기 위해서 1차 실험으로 국내에서 유통되는 국화 64품종 중에 8품종을 대상으로 개발된 31개의 마커를 분석하여 유전적 다형성 정보 함유량(Polymorphic Information Conent) 등을 측정 하였고 평균 0.779로 높게 나타내었다.
분석결과와 모세관전기영동 결과를 가지고 유전분석용 마커 9개와 품종판별용 마커 22개를 선발을 하였다. 2차 실험으로 국화 64품종을 대상으로 교배집단에서 유전자형 검증을 할 수 있는 유전 분석용 마커 9개를 활용하여 국화 품종의 계통수를 작성한 결과 총 4개 그룹으로 나누어졌고 64품종 모두를 Dendrogram으로 나타낼 수 있었다.
본 연구는 기존에 활용되지 못하였던 국화의 염기서열을 활용하여 국내 국화 품종의 다형성 평가와 품종 구별 등 육종 분야와 품종 보호에 적용 가능한 SSR마커를 개발하는 것에 목적이 있다.
향후 DNA profile 데이터베이스를 구축하고, SSR 마커를 이용하여 우리나라 국화 품종 육성과 유전분석 및 품종 판별에 대한 활용도를 높이는 기초자료를 제공하면서 기존에 개발 되었던 SSR 마커의 결과를 보완하고, 국내 유통 국화의 유전적 다양성과 집단구조를 분석하여 기존 연구 결과의 정확도를 높일 것으로 기대된다.
개발된 SSR 마커 50개 중 PCR 증폭된 31개의 마커를 선발하였고, 활용성을 검증하기 위해서 1차 실험으로 국내에서 유통되는 국화 64품종 중에 8품종을 대상으로 개발된 31개의 마커를 분석하여 유전적 다형성 정보 함유량(Polymorphic Information Conent) 등을 측정 하였고 평균 0.779로 높게 나타내었다.
분석결과와 모세관전기영동 결과를 가지고 유전분석용 마커 9개와 품종판별용 마커 22개를 선발을 하였다. 2차 실험으로 국화 64품종을 대상으로 교배집단에서 유전자형 검증을 할 수 있는 유전 분석용 마커 9개를 활용하여 국화 품종의 계통수를 작성한 결과 총 4개 그룹으로 나누어졌고 64품종 모두를 Dendrogram으로 나타낼 수 있었다.
본 연구는 기존에 활용되지 못하였던 국화의 염기서열을 활용하여 국내 국화 품종의 다형성 평가와 품종 구별 등 육종 분야와 품종 보호에 적용 가능한 SSR마커를 개발하는 것에 목적이 있다.
향후 DNA profile 데이터베이스를 구축하고, SSR 마커를 이용하여 우리나라 국화 품종 육성과 유전분석 및 품종 판별에 대한 활용도를 높이는 기초자료를 제공하면서 기존에 개발 되었던 SSR 마커의 결과를 보완하고, 국내 유통 국화의 유전적 다양성과 집단구조를 분석하여 기존 연구 결과의 정확도를 높일 것으로 기대된다.
목차
논문요약 ⅰList of Tables ⅴList of Figures ⅵⅠ. 서언 1Ⅱ. 연구사 31. 국화의 분류 32. SSR 마커 개발 33. 품종식별 및 데이터베이스 구축 4Ⅲ. 재료 및 방법 51. 국화 SSR 마커 개발 51) 국화 SSR 대량추출 52) Primer design 63) PCR 증폭 및 Primer 선발 62. 유전분석용과 품종판별용 마커 선발(1차 실험) 61) 공시재료(국화 8품종) 62) DNA 추출 및 PCR 증폭 확인 73) 다형성 지수 계산 및 마커 사진 분석 83. 선발된 유전분석용 9개의 마커로 유연관계 분석(2차 실험) 91) 공시재료(국화 64품종) 92) DNA 추출 및 PCR 증폭 확인 113) 다형성 지수 계산 및 품종 간 계통도 작성 11Ⅳ. 결과 및 고찰 131. Short read assembly, Polymorphic SSR sequence 추출 및 확인 132. 8품종으로 SSR 마커 분석 및 선발 141) 개발된 31개 마커의 분석 142) 유전분석용 마커와 품종판별용 마커 선발 193. 유전분석용 마커의 재현성 확인 264. 국화 64품종 유연관계 분석 315. 선발한 SSR 마커의 활용 431) 마커 활용 국화 품종 확인 432) 마커 활용 국화 세대확인 456. 종 판별 체계 구축 47Ⅴ. 적요 48참고문헌 49Summary 51
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