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논문 기본 정보

자료유형
학위논문
저자정보

양송이 (강원대학교, 강원대학교 일반대학원)

지도교수
이성진
발행연도
2018
저작권
강원대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.

이용수3

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

초록· 키워드

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한국 재래계는 1910년대 일본의 개량종의 도입과 한국전쟁을 거치며 멸종에 가까운 위기를 맞이했으며, 전후 몰락한 양계업의 복원을 위한 외래계의 도입과 외래계에 비해 낮은 경제 형질로 생산성이 뒤쳐지고 있는 실정이다. 그러나 국립축산과학원의 종축사업단 프로젝트의 일환으로 국내 원종계를 복원, 개발하고 있으며 우수 유전자원을 이용한 산란 및 산육 관련 표지인자를 분석하여 보다 나은 기초 계군을 확립 중 이다. 재래계는 해외 각국에서 자국민들에게 선호도가 높고, 한국 재래계는 육계에 비하여 생산성은 떨어지지만 한국인의 취향에 적합한 풍미와 식감으로 소비율이 증가하는 추세이다. Hepatocyte nuclear factor 4, alpha (HNF4α) 유전자는 간, 췌장과 신장 등의 전사인자를 코딩하는 유전자로 간세포의 분화, 약물 및 지질 대사, 포도당 대사에 연관된 단백질의 발현을 조절하며, 변이에 따라 장내 미생물의 항상성 및 기능성, 췌장의 베타 세포의 발달과 분화에 따른 인슐린 분비의 조절, 제 2형 당뇨병의 발현과 연관되어있다. HNF4α 유전자는 인체 내에서 지방대사와 당뇨병에 미치는 영향에 대하여 많은 연구가 진행되어왔으나 닭과 관련된 연구는 미비한 실정이며, 그마저도 외래육계에서의 연관성이 조사되었을 뿐이다. 본 연구는 HNF4α 유전자의 변이가 한국 재래닭의 증체량 개선에 미치는 영향에 대하여 조사하고자 이 유전자를 증체량 개선을 위한 후보유전자로 선정하였다. 실험을 위한 공시동물은 경남과학기술대학교의 부설 농장에서 사육 중인 한국 재래계 764수를 공시 받았으며 날개하정맥에서 채취한 혈액에서 genomic DNA를 추출하였다. sequencing과 유전자형 분석을 위한 각각의 primer쌍은 NCBI GeneBank (Acession #NC_006107.4)에서 고시되어있는 닭의 HNF4α유전자의 염기서열 정보를 참고하여 고안되었다. PCR을 통해 얻어진 722bp의 산물에서 rs731246957 SNP의 유전자형을 확인하였으며, sequencing을 위한 627bp의 PCR 산물은 Multiscreen filter plate를 이용하여 정제하였으며, Sequencing BigDye Terminator v3.1 cycle sequencing kit와 ABIPRISM 3730XL Analyzer를 이용하여 HNF4α유전자의 일부 염기서열을 분석하였다. rs731246957 SNP는 외래육계뿐만 아니라 한국 재래계의 증체량에서 유의적 연관성을 보였으며, sequencing으로 분석된 14개의 SNP 중 rs731246957 SNP를 포함한 2개의 SNP이 재래계의 체중과 유의적 연관성이 있었다. 연구 결과, HNF4α유전자 내 rs731246957 SNP와 rs736159604 SNP의 유전자형 빈도가 유사하게 나타났으며, wild type 유전자형이 한국 재래계의 체중 증가에 유의적 연관성(P<0.001)이 있었으므로 산육형질 개선을 위한 DNA 분자 마커로써 활용될 수 있을 것으로 사료된다. 또한 position 5567012에 위치한 SNP는 기존에 밝혀진 바 없는 새로운 SNP로 재래계의 체중과 유의적 연관성은 나타나지 않았으나, 실험개체를 추가하여 후속실험을 진행해볼 필요가 있다고 생각된다.

목차

목 차 I
LIST OF FIGURES III
LIST OF TABLES IV
Ⅰ. 서 론 1
Ⅱ. 연구사 4
1. 한국 재래계의 기원 4
2. 한국 재래계의 특징과 보존의 필요성 6
3. 한국 재래계의 육종 방법 9
1) 전통적인 육종 9
2) 분자유전학적 육종 9
4. DNA 표지인자 11
1) Microsatellite 11
2) Single nucleotide polymorphism 12
3) Copy number variation 12
5. 유전자형 분석방법 13
1) Restriction fragment length polymorphism(RFLP) 13
2) Single strand conformation polymorphism(SSCP) 15
3) DNA sequencing 17
Ⅲ. 재료 및 방법 19
1. 공시재료 및 성장형질 측정 19
1) 공시재료 19
2) 성장형질 측정 19
3) Genomic DNA 분리 및 정제 20
2. PCR-RFLP 21
1) Primer 제작 21
2) PCR 증폭 21
3) 유전자형 분석 22
3. DNA TARGETED SEQUENCING 23
1) Primer 제작 23
2) PCR 증폭 25
3) DNA 염기서열 및 유전자형 분석 26
4. 통계 분석 28
Ⅳ. 결과 및 고찰 29
1. 한국 재래계의 증체량 29
2. PCR-RFLP 결과 30
1) 한국 재래계 HNF4α 유전자 내 rs731246957 SNP의 유전자형 분석 30
2) 한국 재래계 HNF4α 유전자 내 rs731246957 SNP와 증체량과의 유의성 분석 34
3. DNA TARGETED SEQUENCING 36
1) 한국 재래계 HNF4α 유전자의 염기서열 분석 및 SNP 유전자형 분석 36
2) 한국 재래계 HNF4α 유전자 내 rs736159604 SNP와 생체중과의 연관성 분석 39
Ⅴ. 결론 41
Ⅵ. 참고문헌 43
Ⅶ. 영문초록 54

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