한우에서의 myosattin 유전변이와 도체형질간 연관성분석 :Association analysis of carcass traits and genetic variation of myostatin in Hanwoo

이준섭

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자료유형: 학위논문

저자정보: 이준섭 (강원대학교, 강원대학교 대학원)

지도교수: 이성진

발행연도: 2015

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2016

한우에서의 Myostatin 유전변이와 도체형질간 연관성 분석

이준섭 , 김현주 , 김형철 외 3명 동물자원연구 2016.12 학술저널

2015

한우에서의 myosattin 유전변이와 도체형질간 연관성분석

이준섭 동물생명공 2015.01 학위논문

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한우에 있어서 종모우 선발과정은 당대검정 28개월과 후대검정 38개월을 포함하여 66개월(5.5년)이라는 오랜 시간과 비용을 소비하여야 종모우를 선발할 수 있다. 또한 분자육종의 기술력은 NGS(Next Generation Sequencing)기법의 활용으로 대규모의 sequencing을 빠르고 저렴하게 이용할 수 있게 되었다. NGS기법의 발전으로 한우에 있어서 경제형질에 영향을 미치는 양적유전자위(QTL; Quantitative Trait Loci)을 확인 할 수 있으며, 분자육종을 이용한 마커도움선발(MAS; Maker Assisted Selection)을 활용하여 분자육종의 활용이 가능해졌다. 마커도움선발은 기존의 개량방식인 표현형정보와 혈통정보를 이용한 최적선형불평추정(BLUP; Best Linear Unbiased Prediction) 방식의 육종가에 추가적으로 보다 정확하고 빠른 정보를 알 수 있는 유전자 정보 효과를 포함하여 종합적인 육종가를 구할 수 있다.
현재까지 한우는 육질 개량에 중점을 둔 연구가 많이 진행되어왔다. 이는 1993년 이후 한우의 소비의 형태가 육량보다는 질 좋은 고기를 선호하면서 육질에 대한 연구가 활발해 진 것으로 사료된다. 마커도움선발(MAS)을 이용한 연구 역시 육질에 대한 연구가 많이 진행되었다. 하지만, 한우에 있어서 유전적 다양성과 육량에 의한 경제 효과를 높이기 위해 육량에 대한 연구의 필요성을 느꼈다. 따라서 본 연구는 양적유전자위 중 육량에 효과적인 myostatin유전자를 마커도움선발에 이용하고자, 한우개체에서의 myostatin 유전적 변이와 도체형질간의 연관성을 분석하였다.
실험개체는 한우DNA 1152두를 이용하였고, myostatin 유전변이를 가지고 있는 SNP(Single Nucleotide Polymorphism) 14개를 이용하여 Real time PCR분석을 실시하였다. 이중 4개의 SNP은 한우에서 다양성을 보이지 않아 통계에서 제외하였다. 통계방법은 ASREML 프로그램을 이용하여 ANOVA분석방법으로 유전자형과 개체의 표현형질간의 분석을 실시하였다. 이 10개의 SNP과 표현형질(도체중, 등심단면적, 등지방두께, 근내지방도, 육량지수)과의 연관성 분석을 실시한 결과 5개의 부분에서 유의적 차이를 볼 수 있었다. 본 연구에서 모든 SNP이 각각의 형질에 유의적 차이를 볼 수는 없었으나, 각 형질에서 유의적 차이를 보인 SNP을 확인 할 수 있었고, 한우에 있어서 myostatin 유전자에 관한 다양성을 확인 할 수 있었다.

It is possible to select breeding bulls of Hanwoo only if investing tremendous amount of money and time of 66 months (5.5 years) including a 28-month performance test and a 38-month progeny test. In addition, with regard to molecular breeding technology, the use of NGS (Next Generation Sequencing) methods has enabled us to perform large scale sequencing faster and cheaper. The development of NGS methods has made it possible to confirm QTL (Quantitative Trait Loci) affecting economic traits of Hanwoo, and the use of MAS (Marker Assisted Selection) with molecular breeding has enabled the use of molecular breeding. MAS makes it possible to obtain overall breeding value by adding the effects of genetic information capable of obtaining more accurate information to the breeding value by BLUP (Best Linear Unbiased Prediction) using previous improvement methods such as phenotype information and pedigree information.
Thus far, there have been many studies focusing on meat quality improvement for Hanwoo. It is considered that studies on meat quality have been actively conducted because beef consumption has changed from quantity to quality since 1993. Moreover, many studies on meat quality using MAS have been conducted. However, there is a need to study quantity of meat in order to enhance the economic effect by genetic diversity and quantity of meat for Hanwoo. Therefore, in order to use a myostatin gene affecting meat quantity among quantitative genes for MAS, this study analyzed the association between genetic variation of myostatin gene in individuals of Hanwoo and carcass traits.
1,050 Hanwoo for were used for the experiments, and real-time PCR analysis was performed using 14 SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) with variation of myostatin gene. Among them, 4 SNPs were excluded from the statistics because they did not represent the diversity in Hanwoo. Analysis between genotypes and individual phenotypic characteristics was performed by ANOVA using ASREML. Association analysis between these 10 SNPs and phenotypic characteristics (dressed weight, Eye Muscle Area, Back-fat thickness, marbling score, yield index). As a result, there are five significant differences. Although all the SNPs did not show significant differences in each trait in this study, some SNPs showed significant differences in each trait. The diversity of myostatin gene was found in Hanwoo.
In order to improve meat quantity with more certainty, there is a need for methods to enhance the effect with additional research on genes affecting meat quantity

#myostatin #한우 #양적유전자위 #마커도움 선발

Ⅰ. 서론 1
Ⅱ. 재료 및 방법 4
1. 공시재료 4
1) 공시재료 4
2) 공시재료 확보 4
3) 경제형질 수집 4
2. genomic DNA 추출 4
1) 재료 및 기구 5
(1) 시약 5
(2) 기구 5
2) 실험방법 5
3) DNA 확인 및 보관 5
3. Myostatin SNP 선발 6
4. RT ? PCR(Polymerase Chain Reaction) 8
5. 통계분석 10
Ⅲ. 결과 11
1. SNP 별 RT - PCR결과 11
2. 표현형질간 연관성 분석 18
3. 표현형질별 정규분포 분석 및 단순회귀분석 19
4. Myostatin SNP과 표현형질간 연관성 분석 25
Ⅳ. 결론 30
Ⅶ. 참고문헌 32

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