계절 변화에 따른 제주도 해면의 공생세균 다양성 연구 :Seasonal Shift of Bacterial Diversity in Jeju Sponges

정종빈

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자료유형: 학위논문

저자정보: 정종빈 (한남대학교, 한남대학교 대학원)

지도교수: 박진숙

발행연도: 2015

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2015

제주도에 서식하는 Petrosia corticata 해면의 배양가능한 공생세균 군집구조의 계절적 차이

정종빈 , 박진숙 한국해양바이오학회지 2015.12 학술저널

계절 변화에 따른 제주도 해면의 공생세균 다양성 연구

정종빈 생명시스템과학과 2015.01 학위논문

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2012년 1월부터 2014년 6월까지 제주도 무릉아치와 용머리해안에서 채집한 4종 15개체의 해양 해면을 이용하여 배양법과 비배양법을 통하여 계절에 따른 공생세균 군집구조를 조사하였다.
배양법을 이용하여 Petrosia corticata의 계절에 따른 공생세균 군집구조를 비교한 결과 4문 5강으로 구성되어 문 수준에서는 동일한 군집구조를 나타내었으나 종 수준에서는 겨울 해면이 여름 해면에 비해 더 다양한 군집구조를 나타내었다.
비배양법을 이용하여 계절에 따른 공생세균 군집구조를 비교한 결과 조간대에 서식하는 Hymeniacidon flavia 해면은 여름 해면에서 1문 2강, 겨울 해면에서 2문 3강으로 구성되었으며, Callyspongia elegans 해면은 겨울 해면에서 3문 6강, 여름 해면에서 2문 4강으로 나타났으며, Cliona sp. 해면은 여름 해면에서 3문 4강, 겨울 해면에서 3문 5강으로 구성되어 본 연구에 사용된 해면에서 공생세균 군집구조는 계절에 따른 차이를 나타내었다. 여름에 채집한 해면에서는 Alphaproteobacteria가, 겨울에 채집한 해면에서는 Alphaproteobacteria와 Gammaproteobacteria가 공통적으로 존재하였다.
본 연구 결과, 제주도에 서식하는 해면의 공생세균 군집구조는 계절에 따른 변화가 있음을 확인하였으며 해면 종에 따라 군집구조의 변화의 폭이 다양함을 알 수 있었다. 또한 실험에 사용된 모든 해면에서 여름에 비해 겨울에 더 다양한 공생세균 군집의 구조를 나타냄을 확인할 수 있었다.

#Sponge #Bacteria #Seasonal

서론 1
재료 및 방법 4
1. 재료 4
1-1. 해면시료의 채집 4
2. 방법 10
2-1. 해면공생세균의 분리 및 배양 10
2-2. DNA 추출 및 16S rRNA gene의 증폭 10
2-3. RFLP 분석 11
2-4. Total genomic DNA 추출 11
2-5. 16S rRNA gene의 DGGE-PCR 증폭 11
2-6. DGGE 전기영동 12
2-7. DGGE 밴드의 동정 및 계통학적 분석 12
결과 14
1. RFLP를 이용한 Petrosia corticata 해면의 계절에 따른 공생세균 군집구조 비교 14
1-1. 해면공생세균의 분리 및 RFLP 분석 14
1-2. 염기서열 분석 및 계통학적 분석 25
2. DGGE를 이용한 조간대해면 Hymeniacidon flavia의 계절에 따른 공생세균 군집구조 비교 34
2-1. DGGE 밴드 양상 34
2-2. 염기서열 분석 및 계통학적 분석 36
3. DGGE를 이용한 Callyspongia elegans 해면의 계절에 따른 공생세균 군집구조 비교 40
3-1. DGGE 밴드 양상 40
3-2. 염기서열 분석 및 계통학적 분석 42
4. DGGE를 이용한 Cliona sp. 해면의 계절에 따른 공생세균 군집구조 비교 48
4-1. DGGE 밴드 양상 48
4-2. 염기서열 분석 및 계통학적 분석 50
고찰 54
참고문헌 61
적요 68
Abstract 69

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