약 2,000년 전부터 사육되어진 한국재래닭은 일제강점기 때에 멸종의 위기를 맞았으나 축산과학원의 재래닭 순수화 복원 및 계통 육성사업에 의해 한국재래닭으로서 보존되고 있다. 현재 재래닭은 소규모농가의 형태로 사육되고 있으며 특별한 목적을 가지고 개량된바 없기 때문에 외래종에 비해 낮은 경제 형질로 크게 주목받지 못하였다. 하지만 한국인의 입맛에 맞는 특유의 식감과 최근 조류인플루엔자와 광우병 같은 축산 전염병에 의해 축산물의 수입에 대한 공포감이 조성되며 안전하고 건강한 종계공급의 중요성이 대두됨에 따라 한국재래닭에 대한 기대가 커지고 있다. GHSR단백질은 성장호르몬의 분비를 촉진하는 Ghreiln단백질과 성장호르몬 분비 촉진 물질(GHS)이 결합하는 수용체로서 선행연구에 의하면 성장호르몬의 분비조절에 관여하여 소와 닭을 비롯한 가축의 성장에 관여한다고 알려져 있다. 따라서 GHSR단백질을 암호화하는 GHSR유전자 상의 변이가 성장호르몬과의 상호작용에 의해 재래닭의 성장형질과 연관성이 있을 것이라 기대하며 재래닭의 성장률 개선을 위한 유전적 표지인자로 활용할 후보유전자로 선발하였다. 실험을 위하여 모색에 의해 구분된 한국재래닭 239마리를 축산물 품질평가원으로부터 공시 받았으며 닭의 날개정맥으로부터 추출한 혈액에서 genomic DNA를 추출하였다. 시퀀싱과 SNP 유전자형 분석을 위해 각각의 primer쌍이 고안되었으며 primer는 NCBI Genbank(Accession No.NC_006096.3)에 등록되어 있는 닭의 GHSR유전자의 염기서열 정보를 참고하였다. PCR을 통해서 얻어진 815bp의 재래닭의 DNA 증폭산물은 Millipore plate MSNU030 (Millipore SAS, Molsheim, France)를 이용하여 정제하였으며, BigDye terminator v3.1 sequencing kit와 3730xl automated sequencer (Applied Biosystems, Foster City, CA)를 사용하여 재래닭의 GHSR유전자 intron1 중 일부분의 염기서열을 분석하였다. 시퀀싱을 통해 얻어진 11개의 SNP 중에 유전자형 빈도와 선행연구 결과를 고려하여 241C>T SNP을 재래닭의 선발육종을 위한 분자유전학적 표지자 후보로 선발하였다. 유전적 표지자로서의 활용가능성을 확인하기 위하여 재래닭 6개 집단에서 Hin6I제한효소를 이용한 PCR-RFLP를 통한 유전자형 분석을 수행하였다. 재래닭 집단을 대상으로 GHSR유전자 241C>T SNP의 유전자형을 분석한 결과 재래백계 집단에서 TT유전자형의 빈도가 0.75로 가장 높았으며, CT 0.20, CC 0.05순으로 나타났다. 재래흑계와 재래황계, 재래적계에서도 각각 TT 0.98, 0.93, 0.90으로, CT 0.02, 0.08, 0.10로, CC 유전자형은 관측되지 않았다. 반면 재래재계에서는 CC유전자형이 0.47, CT 0.36, TT 0.17로 CC 유전자형이 가장 높은 빈도를 보였다. 오골계의 경우엔 CT유전자형이 0.39로 가장 높게 관찰되었으며 각각 0.36, 0.39로 TT, CC유전자형이 뒤를 이었다. 여섯 개의 재래닭 집단에서의 GHSR유전자 241C>T SNP과 경제형질과의 연관성을 분석하기 위해서 SAS 프로그램으로 통계처리를 하였고, 그 결과 재래백계와 재래황계에서 각각 270일령 산란수와 270일령 체중에서 유의적인 차이가 나타났다(p<0.05). 재래백계 계통에서 TT유전자형이 CC유전자형보다 평균적으로 6.17개 만큼 높은 산란수를 보였으며 재래황계에서는 TT유전자형이 CT유전자형보다 270일령 체중이 609.32g 높게 관측되었다. 본 연구결과로 미루어 볼 때 GHSR유전자내 241C>T SNP은 재래계의 품질 계량을 위한 선발 육종에 도움이 되는 유전적표지자로 활용할 수 있으며, 재래닭과 관련된 분자유전학적 연구의 기초자료가 될 것이라 사료된다.

Growth hormone secretagogue receptor(GHSR), or Ghrelin receptor, modulate many physiological functions including growth hormone(GH) secretion from pituitary, food intake and energy expenditure by binding its ligand. The chicken GHSR gene is physically comprised of two exons and one intron and located on chromosome nine in chicken genome. Untill now, some polymorphisms of the GHSR gene were reported that it affects bovine and chicken growth performance. But the association between GHSR gene polymorphisms and economic traits in Korean native chicken population remains unclear. The object of this study was to discovery novel SNP(single nucleotide polymorphisms) in GHSR gene and to analyze the association with SNP(241C>T) and economic traits of Korean native chicken(KNC). We used a total of 239 genomic DNAs from six breeds of Korean Native chicken population and measured economic traits such as age at first egg(AFE), weight of first egg(WFE), egg number(EN), egg weight(EW), body weight at 150 days(BW150) and body weight at 270days(BW270) to investigate association between 241C>T SNP and chicken economic trait. We performed direct sequencing at the region of intron in GHSR gene to discovery novel SNPs in Korean Native chicken breeds using ABI PRISM 3730XL Analyzer. The 241C>T SNP, genotyped by polymorphism chain reaction restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP) using Hin6I, was identified in Korean native chickens. By direct sequencing for intron in GHSR gene, three novel SNPs were discovered. The association analysis between SNP in GHSR gene and economic trait of KNC using the SAS program revealed that 241C>T SNP was significantly affected with body weight(BW) at 270days in KNC(Yellow)(p<0.05) and egg number(EN) in KNC(White)(p<0.05), respectively. In conclusion, these results may be useful as a fundamental study for the improvement of KNC breeds. These results suggest that a 241C>T SNP located in GHSR gene could be useful as a genetic marker of Korean native chicken.