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국내 부패한 나무에서 분리된 세균 Pseudoxanthomonas putridarboris WD12<sup>T </sup>(=KACC 15045<sup>T</sup>, =LMG 25968<sup>T</sup>)의 초안 유전체 염기서열을 Illumina 플랫폼을 사용하여 결정하였다. 초안 유전체는 총 4,227,685 bp의 길이와 67.5% G + C 함량으로 구성되었으며, 총 3,681개의 단백질 코딩, 6개의 rRNA, 49개의 tRNA 암호화 유전자, 5개의 비암호화 RNA 유전자, 그리고 54개의 유사 유전자를 포함하였다. Pseudoxanthomonas 속의 표준 균주 유전체 서열은 유전체 기반의 분류상에서 기준 유전체로 사용될 수 있다. 또한 생분해성 고분자를 분해하는 세포 외 단백질분해효소, β-glucosidases 및 xylanase를 암호화하는 유전자들은 산업적 응용에 활용될 수 있을 것이다.
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Achtman M and Wagner M. 2008. Microbial diversity and the genetic nature of microbial species. Nature Rev. Microbiol. 6, 431–440.
Cho WD, Lee JK, Lim CS, Park A, Oh YS, and Roh DH . 2010. Isolation of Pseudoxanthomonas sp. WD12 and WD32 producing extracellular protease. Korean J. Microbiol. 46, 63–67.
Eriksson KEL, Blanchette RA, and Ander P. 2012. Microbial and enzymatic degradation of wood and wood components. Springer Science & Business Media.
Farris JS. 1972. Estimating phylogenetic trees from distance matrices. The American Naturalist 106, 645–668.
Finkmann W, Altendorf K, Stackebrandt E, and Lipski A. 2000. Characterization of N2O-producing Xanthomonas-like isolates from biofilters as Stenotrophomonas nitritireducens sp. nov., Luteimonas mephitis gen. nov., sp. nov. and Pseudoxanthomonas broegbernensis gen. nov., sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50, 273–282.
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Farris JS. 1972. Estimating phylogenetic trees from distance matrices. The American Naturalist 106, 645–668.
Finkmann W, Altendorf K, Stackebrandt E, and Lipski A. 2000. Characterization of N2O-producing Xanthomonas-like isolates from biofilters as Stenotrophomonas nitritireducens sp. nov., Luteimonas mephitis gen. nov., sp. nov. and Pseudoxanthomonas broegbernensis gen. nov., sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50, 273–282.
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