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대사경로 3,490개가 고세균 471종에 분포하는 정도를 MetaCyc database의 자료를 이용하여 분석하였다. 대사경로의 수는 고세균의 종류에 따라 13~184개가 존재하였다. 모든 고세균에 공통적으로 존재하는 대사경로는 없었으며 470종의 고세균에 UTP and CTP de novo biosynthesis와 tRNA charging의 대사경로가 존재하였다. 고세균들에 분포하는 상위 12개의 대사경로 중에서 핵산관련이 5개, 단백질관련이 5개 그리고 생체의 여러 반응에 참여하는 cofactor인 S-adenosyl-L-methionine (SAM)의 생합성 대사경로와 효소의 활성에 필수적인 번역 후 변형에 필요한 phosphopantothenate biosynthesis III (archaea)의 대사경로로 나타나 핵산과 물질대사와 관련된 단백질의 중요성을 알 수 있었다. 대사경로 보유 계통수에서 구한 distance value를 이용하여 고세균의 각 강(class)을 평균과 표준편차로 나누었을 때, 2개의 그룹과 기타로 나뉘어져 대사경로의 분포가 다양한 것으로 나타났다. 본 연구결과는 기초과학 이외에 약물개발 등에도 응용될 수 있을 것으로 기대된다.
목차
서론
재료 및 방법
결과 및 고찰
References
초록
참고문헌 (12)
참고문헌 신청
Huson, D. H. and Scornavacca, C. 2012. Dendroscope 3: An interactive viewer for rooted phylogenetic trees and networks. Syst. Biol. 61, 1061-1067.
Kumar, S., Stecher, G., Li, M., Knyaz, C. and Tamura, K. 2018. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Mol. Biol. Evol. 35, 1547-1549.
Lee, D. G., Kim, J. H. and Lee, S. H. 2019. Conserved genes and metabolic pathways in prokaryotes of the same genus. J. Life Sci. 29, 123-128.
Lee, D. G., Kim, J. H. and Lee, S. H. 2022. Metabolic pathways of 1309 prokaryotic species in relation to COGs. J. Life Sci. 32, 249-255.
Lee, D. G. and Lee, S. H. 2021. Investigation of COGs (Clusters of Orthologous Groups of proteins) in 1,309 species of prokaryotes. J. Life Sci. 31, 834-839.
Kumar, S., Stecher, G., Li, M., Knyaz, C. and Tamura, K. 2018. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Mol. Biol. Evol. 35, 1547-1549.
Lee, D. G., Kim, J. H. and Lee, S. H. 2019. Conserved genes and metabolic pathways in prokaryotes of the same genus. J. Life Sci. 29, 123-128.
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