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Choi Jungwon (Yonsei University) Hyun Jungheun (Yonsei University) Hyun Jieun (Yonsei University) Kim Jae-Hee (Yonsei University) Lee Ji Hyun (Kyung Hee University) Bang Duhee (Yonsei University)
저널정보
대한생화학·분자생물학회 Experimental and Molecular Medicine Experimental and Molecular Medicine Vol.56
발행연도
2024.2
수록면
453 - 460 (8page)
DOI
10.1038/s12276-024-01164-8

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The major drawbacks of RNA sequencing (RNA-seq), a remarkably accurate transcriptome profiling method, is its high cost and poor scalability. Here, we report a highly scalable and cost-effective method for transcriptomics profiling called Bulk transcriptOme profiling of cell Lysate in a single poT (BOLT-seq), which is performed using unpurified bulk 3′-end mRNA in crude cell lysates. During BOLT-seq, RNA/DNA hybrids are directly subjected to tagmentation, and second-strand cDNA synthesis and RNA purification are omitted, allowing libraries to be constructed in 2 h of hands-on time. BOLT-seq was successfully used to cluster small molecule drugs based on their mechanisms of action and intended targets. BOLT-seq competes effectively with alternative library construction and transcriptome profiling methods.

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