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저자정보
서정우 (주식회사 진앱스) 이학교 (전북대학교) 박경도 (전북대학교 동물생명공학과) 이준호 (주식회사 진앱스)
저널정보
한국동물유전육종학회 Journal of Animal Breeding and Genomics Journal of Animal Breeding and Genomics Vol.7 No.1
발행연도
2023.3
수록면
17 - 24 (8page)

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최근 국내에 저지 젖소 품종이 도입되어 사육되고 있으나 도입된 저지소의 개체수는 홀스타인 품종에 비해 상대적으로 적고 관련 연구도 부족한 상황이다. 본 연구는 국내 저지종 집단과 홀스타인종 집단에서 구성한 고밀도 유전제 정보의 유전적 다양성 및 연관불평형의 차이를 비교를 통하여 집단유전학적 특성을 비교하기 위하여 수행하였다. 고밀도 유전체 정보는 홀스타인종 집단과 저지종 집단 모두에서 같은 종류의 SNP chip을(Illumina BovineSNP50 version3) 이용하여 분석된 유전자형 자료로 총 SNP 마커 수는 53,218개이고 저지종은 120두, 홀스타인종은 921두가 분석에 이용되었다. 연관불평형에 대한 공평한 비교를 위하여 품질평가를 완료한 뒤 두 품종에서 공통된 29,127개의마커를 선택하였다. 유전체 전장의 모든 SNP 마커의 유전자 빈도를 비교하였으며, 특히 한 품종에서만 다형성이 존재하는 마커들을 탐색하였다. 일배체형으로 구성되어지는 두 좌위의 대립유전자간 빈도 상관계수의 제곱으로 나타내어지는 r2의 계산을 통하여 품종별 연관불평형을 추정하였다. 대립유전자빈도, 이형접합성, 일배체형의 r2 및 유효집단 크기 비교에서 저지종의 유전적 다양성이 작은 것으로 나타났다.

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