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저자정보
Sung-Woong Kim (Chonnam National University) Hyo-Jeong Lee (Chonnam National University) Sena Choi (Rural Development Administration) In-Sook Cho (Rural Development Administration) Rae-Dong Jeong (Chonnam National University)
저널정보
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal The Plant Pathology Journal 제39권 제3호
발행연도
2023.6
수록면
303 - 308 (6page)

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The global climate change and international trade have facilitated the movement of plants across borders, increasing the risk of introducing novel plant viruses in new territories. Ixora coccinea exhibited virus-like foliar symptoms, including mosaic and mild mottle. An Oxford Nanopore Technologies-based compact and portable MinION platform was used to identify the causal viral pathogen. The complete genome sequence of jasmine virus H (JaVH; 3867 nt, JaVH-CNU) was determined and found to share 88.4-90.3% nucleotide identity with that of Jasminum sambac JaVH isolate in China. Phylogenetic analysis based on the complete amino acid sequences of RNA-dependent RNA polymerase and coat protein revealed that JaVH-CNU was grouped separately with other JaVH isolates. This is the first report of a natural JaVH infection of I. coccinea. The application of rapid nanopore sequencing for plant virus identification was demonstrated and is expected to provide accurate and rapid diagnosis for virus surveillance.

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