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변산반도국립공원 고정조사구내의 식물상은 73과 164속 219종 23변종 6품종으로 총 248분류군이 확인되었 다. 식물상 중 법정보호종인 멸종위기야생식물 II급에 미선나무와 노랑붓꽃이, IUCN 평가기준에 따른 희귀식물은 개족도리, 호랑가시나무, 미선나무, 이팝나무, 노랑붓꽃 등 5분류군, 특산식물은 은사시나무, 개족도리, 고광나무, 떡 윤노리, 미선나무, 청괴불나무, 병꽃나무, 노랑붓꽃 등 8분류군이 확인되었다. 또한 식물구계학적 특정식물종은 V등 급에 미선나무, IV등급에 해당되는 식물종은 확인되지 않았으며, III등급에 단풍나무, 꽝꽝나무, 호랑가시나무, 이나 무, 호자덩굴, 새비나무, 털괴불나무, 청괴불나무, 노랑붓꽃 등 9분류군, II등급에 큰참나물, I등급에 쇠고비, 전나무, 물오리나무, 굴참나무, 푸조나무, 후박나무, 투구꽃, 큰꽃으아리, 개구리발톱, 개족도리, 돈나무, 예덕나무, 상산, 합다 리나무, 나도밤나무, 대팻집나무, 사철나무, 말오줌때, 거지덩굴, 장구밥나무, 보리밥나무, 오갈피, 송악, 정금나무, 이 팝나무, 올괴불나무, 천문동, 조릿대풀 등 28분류군으로 총 39분류군(전체 248분류군의 관속식물 중 15.7%에 해당) 이 확인되었다. 변산반도국립공원 고정조사구내의 귀화식물은 가죽나무와 아까시나무만이 확인되었다.
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