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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 발행연도
- 2012.8
- 수록면
- 85 - 92 (8page)
이용수
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본 연구는 ICuGI Database를 활용하여 수박 상용 F1 품종의 순도검정용 EST-SSR 마커를 개발하기 위해 수행되었다. 총 353개 EST-SSR primer set을 선발하여 (주)NH종묘의 수박 F1 품종 7종과 각 품종의 양친 11종에 대해 검정하였다. 이중 1차 테스트한 96개 primer set 중, ‘오렌지’는 primer WMU0056, ‘흑보’는 WMU0400, ‘신동’은 WMU0056와 WMU0400, ‘새로나’는 WMU0056, WMU0400, WMU0529에 대해 각 품종의 양친들이 다형성이 보였고 F1 개체에서는 이형접합의 유전자형을 보였다. ‘해동’ F1의 순도검정용 마커를 찾기 위해 추가적인 122개의 primer set에 대해 PCR을 수행한 결과, WMU0056, WMU0400, WMU0580, WMU1211, WMU4136, WMU448이 순도검정에 적합한 것으로 나타나, WMU0056와 WMU0400이 ‘해동’에서도 유용할 수 있었다. ‘꿀나라’와 ‘황피’의 경우에는 공시된 타 품종들에 비해 양친간 다형성율이 각각 5%와 2%로 매우 낮아 모든 353개 primer set을 테스트하였으며, 그 결과 ‘꿀나라’는 WMU5339, ‘황피’는 WMU7003이 순도검정 마커로 적합한 것으로 확인되었다. 개발된 마커를 이용하여 실제 농가채종된 4개의 F1 품종의 순도를 검정한 결과, 모두 97.5% 이상의 순도로 확인되었다. 이와 같이 ICuGI Database에 공시된 수박 EST-SSR 마커는 공우성의 유전자 특이적 마커로서 F1 순도검정에 효과적으로 사용될 수 있었다.
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Guerra-Sanz, J. M / 2002 / Citrullus simple sequence repeats markers from sequence databases / Mol. Ecol. Notes 2:223~225
Hwang, J. H / 2011 / Genetic diversity in watermelon cultivars and related species based on AFLPs and EST-SSRs / Not. Bot. Horti. Agrobo 39:285~292
Hwang, J. H / 2011 / Functional characterization of watermelon (Citrullus lanatus L.) EST-SSR by gel electrophoresis and high resolution melting analysis / Sci. Hort 130:715~724
Hyo Guen Park / 2004 / Application of RAPD and SCAR Markers for Purity Testing of F1 Hybrid Seed in Chili Pepper (Capsicum annuum) / Molecules and Cells 18(3):295~299
Kong, Q / 2012 / Identification and development of polymorphic EST-SSR markers by sequence alignment in pepper, Capsicum annuum / Am. J. Bot :e59~e61
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Kong, Q / 2012 / Identification and development of polymorphic EST-SSR markers by sequence alignment in pepper, Capsicum annuum / Am. J. Bot :e59~e61
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