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저자정보
김원 (우리손F&G) 정종현 (㈜정P&C 연구소) 이상민 (전북대학교) 나종삼 (전북대학교) 황도연 (축산물품질평가원) 정영철 (정 P&C 연구소) 이득민 (한경대학교)
저널정보
경상대학교 농업생명과학연구원(구 경상대학교 시설원예연구소) 농업생명과학연구 농업생명과학연구 제55권 제5호
발행연도
2021.10
수록면
91 - 96 (6page)
DOI
https://doi.org/10.14397/jals.2021.55.5.91

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본 연구는 제주지역에서 사육되고 있는 제주 재래돼지기반의 제주흑돈(제주재래돼지 합성돈)에 대하여 산육형질인 등지방 두께, 일당증체량, 90 kg 도달일령에 대한 후보유전자 탐색을 위해 전장유전체 분석을 실시하였고, 유전체 육종가의 정확도 비교를 위해 베이지안 방법(BayesB, BayesC), (0.00, 0.50, 0.90, 0.99)값과 개체 자신과 후대의 정보만 포함하고 조상의 정보에 대해 정보를 보정한 DEBVexcPA (Deregressed EBV exlude parents average)와 부모 평균을 포함한 DEBVincPA (Deregressed EBV include parents average)의 반응변수를 이용하였다. 산육형질에 대한 전장유전체 분석을 실시한 결과 등지방두께는 KIAA1549 유전자(SSC18 at 11Mb region), 일당증체량과 90 kg 도달일령에서POLD3(SSC9 at 9Mb region), STX6(SSC9 at 134Mb region) 유전자가 공통적으로 탐색되었다. 유전체의 정확도 범위는 일당증체량 BayesB의경우 DEBVexcPA와 DEBVincPA에서 각각 0.285~0.305와 0.497~0.510과 BayesC에서 0.287~0.296와 0.499~0.511으로 추정되었다. 90 kg 도달일령은 BayesB에서 DEBVexcPA와 DEBVincPA는 각각 0.284~0.305와 0.497~0.510, BayesC에서는 0.284~0.296와 0.498-0.511로 추정되었다. 특히, 등지방두께의 유전체 정확도가 BayesB방법론의 DEBVincPA에서 0.625로 가장 높게 추정되었다. 제주흑돈의 산육형질에 대한 유전적인개량 속도를 가속화하기 위해 유전체 선발법을 적용하는데 있어 부모 평균을 포함한 DEBVincPA (Deregressed EBV include parents average)의반응변수를 이용하는 것이 바람직하다고 판단된다.
#베이지안방법 #산육형질 #유전체 육종가 정확도 #전장유전체분석 #제주흑돈 #Bayesian method #Genomic prediction accuracy #GWAS #Jeju Black pigs #Production traits

목차

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Bergamaschi M / 2020 / Gut microbiome composition differences among breeds impact feed efficiency in swine / Microbiome 8:1~15 google schola Dashab GR / 2012 / Comparison of linear mixed model analysis and genealogy-based haplotype clustering with a Bayesian approach for association mapping in a pedigreed population / BMC Proceedings 6:1~5 google schola 가천흥 / 2007 / 개량종 돼지와 재래 흑돼지에서 도체중과 등지방 두께간의 상관 관계 / 동물자원연구 18:111~121 dbpia Garrick DJ / 2013 / Implementing a QTL detection study (GWAS) using genomic prediction methodology / Humana Press :275~298 google schola Garrick DJ / 2009 / Deregressing estimated breeding values and weighting information for genomic regression analyses / Genetics Selection Evolution 41:1~8 google schola

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