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본 논문은 제주연안에서 채집한 소라(Turbo cornutus)의 장내세균을 분리하고 군집의 다양성을 조사하였다. 표준배지를 사용하여 순수 정체 배양 결과 MA agar에서 가장 많은 군집을 나타났다. 일반 배양 CFU값은 평균 1.8×10<SUP>5</SUP>, 혐기 배양 CFU값은 평균 0.4×10으로 보다 적게 나타났다. 기존 표준균주와 16S rDNA sequence 유사도 비교 분석 결과 크게 4문 12과 26속 67종으로 분류되었다. 표준균주와의 상동성 범위는 93-100%로 나타났다. 소라장내세균 군집은 크게 Proteobacteria 39% (α-proteobacteria; Phyllobacteriaceae (1), Rhodobacteraceae (8) / γ-proteobacteria; Alteromonadaecae (1), Shewanellaceae (4), Vibrionaceae(12))로 가장 우점하였고, Firmicutes 34% (Bacillaceae (21), Paenibacillaceae (2)), Actinobacteria 21% (Cellulomonadaceae(1), Mycobacteriaceae (6), Nocardiaceae (4), Streptomycetacea (3)), Bacteroidetes 6% (Flavobacteriaceae (4))로 각각 나타났다. Bacillus sp., Vibrio sp.이 가장 우점 하였으며, 그 외 대부분의 분리 균주는 해양 유래 관련 균주로 나타났다. 이전 보고된 제주 연안에 서식하는 해양동물 장내세균군과 비슷한 양상을 보였다. 분리된 일부 균주가 단당류(Cellulose), 다당류(alginate, agar)분해능을 갖고 있는 것으로 나타났는데, 대부분이 해조류 유래 세균으로 소라의 섭이가 장내세균군과 관련됨을 알 수 있었다. 동시에 probiotics 기능을 갖고 있는 일부 균주도 분리되었다.
목차
서론
재료 및 방법
결과 및 고찰
References
초록
참고문헌 (32)
참고문헌 신청
Barriuso, J., Valverde, J. R. and Mellabo, R. P. 2011. Estimation of bacterial diversity using next generation sequencing of 16S rDNA: a comparison of different workflows. BMC Bioinformatics 12, 473.
Chang, D. S. 2002. Studies on the stock assessment and management of the turban shell, Batillus cornutus in jeju coastal waters, korea. Ph.D. dissertation, Jeju University, Jeju, Korea
EaBMG, S. and Goebel, B, M. 1994. Taxonomic note: a place for DNA-DNA reassociation and 16S rRNA sequence analysis in the present species definition on bacteriology. Int. J. Syst. Bacteriol. 44, 846-849.
Einar, R. G., Sigmund, S., Reider, M. B., Stale, R. and Ashild, K. 2006. Characterisation of the microbiota associated with intestine of atlantic cod (Gadus morhua L.): the effect of fish meal, standard soybean meal and a bioprocessed soybean meal. Aquaculture 261, 829-841.
Elena, P. I., Tomoo. S., Nataliya, M. G., Vassillii, I. S., Valery, V. M., Dan, V. N. and Richard, C. 2001. Shewanella japonica sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51, 1027-1033.
Chang, D. S. 2002. Studies on the stock assessment and management of the turban shell, Batillus cornutus in jeju coastal waters, korea. Ph.D. dissertation, Jeju University, Jeju, Korea
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Einar, R. G., Sigmund, S., Reider, M. B., Stale, R. and Ashild, K. 2006. Characterisation of the microbiota associated with intestine of atlantic cod (Gadus morhua L.): the effect of fish meal, standard soybean meal and a bioprocessed soybean meal. Aquaculture 261, 829-841.
Elena, P. I., Tomoo. S., Nataliya, M. G., Vassillii, I. S., Valery, V. M., Dan, V. N. and Richard, C. 2001. Shewanella japonica sp. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51, 1027-1033.
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