RAPD 분석 기술을 이용한 Cymbidium 속 식물 유연관계 분석

최이진; 김미선

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자료유형: 학술저널

저자정보: 최이진 (서울특별시농업기술센터) 김미선 (농촌진흥청 원예연구소)

저널정보: 한국화훼학회 화훼연구 화훼연구 제23권 제2호

발행연도: 2015.1

수록면: 57 - 62 (6page)

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본 연구는 Cymbidium 원종 및 주요 품종을 대상으로RAPD 분석을 이용하여 이들의 유전적 근연관계를 비교하고, 또한 유전적 구별성과 균일성을 확인하여 이들 생화학적 표지를 품종식별의 지표로 활용함으로써 교배모본을 선정할 때 품종의 기초자료를 얻기 위하여 수행하였다. 심비디움의 PCR 반응조건 구명하고자 각각의 반응액 조건을 알아본 결과 PCR tube(0.5mL)에 10ng template DNA, 100ng primer, 200μM dNTP mixture, 1unit Taq DNA polymerase, 1.5mM MgCl2, 10mM Tris-HCl을 첨가하여 25μL로 조정하여 최적 반응액을 만들었다. PCR 반응 조건은 94oC에서 5분간 예비 변성시키고, 94oC에서 3분 변성, 37oC에서 1분간 primer 접촉및 72oC에서 5분간 증폭시키는 과정을 45회 반복했을때가 가장 효과적이었다. 선발된 10개의 primer로부터87개의 밴드로부터 심비디움 원종 및 품종 30종의 군집분석을 한 결과, 유사도 0.647을 기준으로 2개의 군집으로 분류할 수 있었고, I 집단은 유사도값 0.660을 기준으로 3 소군집, II집단은 유사도값 0.737을 기준으로 3 소군집이 속하였다. II집단 C. ‘Place court’ 와 C. Pure Destiny ‘Ultimate’는 유사도가 0.920으로 높게 나타났다. 중형종인 C. ‘Juulyang’과 C. ‘Tropical Yellow’도 0.908 의 높은 유사도 지수를 보여 근연관계가 가깝게 나타났는데 화색은 초록색과 노란색이며 설판의 색과 화형이 비슷한 특징을 보였다. 본 연구를 통해 심비디움 원종 및품종 30종간의 유전적 근연관계를 밝힘으로써 이후 심비디움 육종 및 유전연구에 유용한 기초자료가 될 수 있을 것으로 생각된다.

#Cymbidium Cultivar #PCR #Breeding #Cluster analysis

참고문헌 (25)

참고문헌 신청

Choi SH / 2006 / Genetic diversity and phylogenetic relationship among and within species of oriental Cymbidiums based on RAPD analysis / Scientia Hort 108:79~85

서상덕 / 2003 / RAPD 방법을 이용한 국내 수입 인삼(Panax ginseng C. A. meyer)의 다양성 분석 / 한국약용작물학회지 11(5):377~384

Chung SY / 2006 / Genetic relationship and differentiation of Paphiopedilum and Phragmepedium based on RAPD analysis / Scientia Hort 109:153~159

Du Puy D / 2007 / The genus Cymbidium / Royal Botanic Gardens :73

Goh MWK / 2005 / Random amplified polymorphic DNA analysis of the moth orchids, Phalaenopsis (Epidendroideae: Orchidaceae) / Euphytica 141:11~22

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