메뉴 건너뛰기
.. 내서재 .. 알림
소속 기관/학교 인증
인증하면 논문, 학술자료 등을  무료로 열람할 수 있어요.
한국대학교, 누리자동차, 시립도서관 등 나의 기관을 확인해보세요
(국내 대학 90% 이상 구독 중)
로그인 회원가입 고객센터 ENG
주제분류
인문학
인문학 일반 역사학 철학 종교학 어문학 기타 인문학
사회과학
사회과학 일반 경영학 관광학 교육학 군사학 문헌정보학 법학 사회학 신문방송학 심리과학 정치외교학 지리학 행정학 경제학 무역학 인류학 기타 사회과학
자연과학
자연과학 일반 물리학 생물학 생활과학 수학·통계학 천문학 지구과학 화학 기타 자연과학
공학
공학 일반 건축공학 기계공학 산업공학 재료·에너지공학 전기전자공학 조선해양공학 화학공학 컴퓨터학 기타공학
의약학
의학 일반 간호학 수의학 약학 한의학 기초의학 임상의학 기타 의약학
농수해양학
농수해양학 일반 농학 수산학 식품과학 임학 축산학 해상운송학 기타 농수해양학
예술체육학
예술 일반 디자인 미술 미용 사진 음악학 의상 체육 공연매체예술 기타 예술체육학
복합학
학제간연구 과학기술학 뇌인지과학 기술정책 기타 복합학

ENG

추천
검색

논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
임용표 (충남대학교) Parameswari Paul (Chungnam National University) Vignesh Dhandapani (Chungnam National University) 최수련 (충남대학교)
저널정보
한국유전학회 Genes & Genomics Genes & Genomics Vol.38 No.6
발행연도
2016.1
수록면
547 - 555 (9page)

이용수

표지
📌
연구주제
📖
연구배경
🔬
연구방법
🏆
연구결과
AI에게 요청하기
추천
검색

초록· 키워드

오류제보하기
Long non-coding RNAs (LncRNAs) are a large, diverse class of RNA molecules that has garnered attention for their potential to regulate gene expression and been identified in various organisms. Here we report the first prediction of lncRNAs in Brassica rapa (B. rapa) genome using computational method. We subjected the publicly available full length cDNA sequences and identified 2237 candidate lncRNAs, characterized their functions based on insilico methods. Housekeeping and small regulatory non-coding RNAs (ncRNAs) were removed from the pool. Although 14–15 % of the total sequences were predicted to be non-coding initially, on filtering only 4.6 % of the total sequences were predicted as lncRNAs carrying a large number of simple repeats. The lncRNAs had an average length of 497 bp and were mapped on each chromosome of B. rapa. They were classified to 4 groups based on their origin. Thirty six motifs involving transcription related activities, signaling mechanism and stress response were identified in the lncRNAs. Repeat elements and neighboring genes of the lncRNAs were analyzed since they were associated in function and regulating the expression of these long non-coding RNAs. We believe that this study would be an initial and reference for any further studies regarding long non-coding RNAs in B. rapa and other Brassica crops.

목차

등록된 정보가 없습니다.

참고문헌 (61)

참고문헌 신청
Altschul SF / 1990 / Basic local alignment search tool / J Mol Biol 215:403~410 google schola Bailey TL / 2011 / DREME: motif discovery in transcription factor Chip-seq data / Bioinformatics 27:1653~1659 google schola Bertani S / 2011 / The noncoding RNA mistral activates Hoxa7 expression and stem cell differentiation by recruiting MLL1 to chromatin / Mol Cell 43:1040~1046 google schola Burge SW / 2012 / Rfam 11.0:10 years of RNA families / Nucleic Acids Res 41:D226~D232 google schola Buske FA / 2010 / Assigning roles to DNA regulatory motifs using comparative genomics / Bioinformatics 26:860~866 google schola

함께 읽어보면 좋을 논문

논문 유사도에 따라 DBpia 가 추천하는 논문입니다. 함께 보면 좋을 연관 논문을 확인해보세요!

이 논문의 저자 정보

최근 본 자료

전체보기

댓글(0)

0