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저자정보
Abebe Megersa (서울대학교) 서정환 (서울대학교) 진중현 (세종대학교) 김백기 (서울대학교) 고희종 (서울대학교)
저널정보
한국육종학회 Plant Breeding and Biotechnology Plant Breeding and Biotechnology Vol.4 No.3
발행연도
2016.1
수록면
297 - 305 (9page)

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Rice varieties developed through the inter-specific crosses between Asian (Oryza sativa L.) and African cultivated rice(O. glaberrima Steud.) have contributed to yield enhancement of African rice. However, the genetic diversity and genetic structure ofthe African varieties have rarely been reported. In this study, we characterized 40 rice varieties including rice released in Africa basedon eleven yield related agronomic traits and 96 single nucleotide polymorphism (SNP) markers. They were grouped into threecategories based on the cluster analysis using agronomic traits. Meanwhile, they were grouped into two distinct clusters, indica- andjaponica-type, based on the genetic distance using 96 SNP markers. CG14, which belongs to O. glaberrima, was found to be anadmixture type between indica and japonica. The number of secondary branches (SBs) was the only agronomic trait which wassignificantly different between two groups. The results of this study provide basic agronomic and genomic information of cultivatedand tested rice varieties for Africa, that would be helpful for further rice varietal improvement in Africa.

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참고문헌 (21)

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Agnoun Y / 2012 / The African rice Oryza glaberrima Steud:knowledge distribution and prospects / Int. J. Biol 4:158~180 google schola Cavalli-Sforza LL / 1967 / Phylogenetic analysis. Models and estimation procedures / Am. J. Hum. Genet 19:233~257 google schola Evanno G / 2005 / Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE:a simulation study / Mol. Ecol 14:2611~2620 google schola Garcia-Vallvé S / 1999 / Horizontal gene transfer in glycosyl hydrolases inferred from codon usage in Escherichia coli and Bacillus subtilis / Mol. Biol. Evol 16:1125~1134 google schola Jena KK / 2010 / The species of the genus Oryza and transfer of useful genes from wild species into cultivated rice, O. sativa / Breed. Sci 60:518~523 google schola

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