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저자정보
계현기 (서강대학교) 크리스티안 (서강대학교) Byeong Seon Park (서강대학교) 이종민 (서강대학교) 정봉근 (서강대학교)
저널정보
한국바이오칩학회 BioChip Journal BioChip Journal Vol.14 No.2
발행연도
2020.1
수록면
195 - 203 (9page)

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Cell free DNA (cfDNA) is degraded DNA fragments found in the blood plasma of cancer patients. While cfDNA is a good marker for early diagnostics and cancer prognosis, the extraction of cfDNA from whole blood and sample preparation for later sequencing is still challenging. Here, we presented a microfluidic device for the removal of cells from a cfDNA sample in a first step. In a second step, carboxylated magnetic beads were used for cfDNA extraction and purification. Lastly, cfDNA was amplified using a lowpower, plasmonic polymerase chain reaction (PCR) system. Using fluorescent-labeled beads, we demonstrated that the separation efficiency for cells was 99% and the mixing efficiency for purification of cfDNA was 94%. Captured cfDNA could be successfully amplified by PCR, as demonstrated by gel electrophoresis. We confirmed that the limit of detection of our microfluidic system was 10 ng/mL.
#Separation #Purification #cfDNA #PCR #Microfluidic device

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참고문헌 (38)

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Leon, S. A. / 1977 / Free DNA in the serum of cancer patients and the effect of therapy / Cancer Res 37:646~650 google schola Breitbach, S. / 2012 / Circulating cellfree DNA / Sports Med. 42:565~586 google schola Gormally, E. / 2007 / Circulating free DNA in plasma or serum as biomarker of carcinogenesis: Practical aspects and biological significance / Mutat. Res 635:105~117 google schola Volik, S. / 2016 / Cell-free DNA (cfDNA): Clinical significance and utility in cancer shaped by emerging technologies / Mol. Cancer Res 14:898~908 google schola Jen, J. / 2000 / An overview on the isolation and analysis of circulating tumor DNA in plasma and serum / Ann. N.Y. Acad. Sci. 906:8~12 google schola

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