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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
Sang Chul Choi (Sungshin Women’s University)
저널정보
한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 제56권 제3호
발행연도
2020.9
수록면
241 - 253 (13page)

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코로나 바이러스 2019, 즉 코로나-19는 전세계적으로 많은 지역에 엄청난 경제적 손실과 정신적인 스트레스를 야기해오고 있다. 중국 중앙 지역에서 발생한 코로나-19는 중국 본토의 다른 지역과 중국 주변 지역으로 빠르게 퍼져나갔다. 중국 동쪽의 일본, 한국, 대만의 세 주변 지역은 각각 코로나-19에 대한 최초 확진을 2020년 1월 중순 즈음에 각각 보고하였다. 이렇게 심각한 폐렴을 일으키는 병원체는 사람에게 감염시키는 코로나바이러스인 SARS-CoV-2이다. 코로나-19 발생 후, SARS-CoV-2 유전체 서열은 GISAID라는 데이터베이스에 아주 빠르게 저장되어 코로나-19 문제 해결에 도움을 주고 있다. 본 논문에서 베이지언 통계 방법으로 계통학 소프트웨어인 BEAST2에 구현된 계통역학 모델을 사용하여 동아시아 세지역의 코로나-19 환자로부터 샘플한 바이러스 유전체에서 계통학적이고 역학적인 신호를 감지한다. 이 세 지역의 코로나-19 바이러스 역학적 유래 날짜와 기본재생산수를 유추하고 비교한다. 그리고, 동아시아에서 샘플한 서열의 수가 적기때문에 데이터로부터 임의 샘플에 대한 계통역학 분석의 민감도를 평가하였다. 이렇게 2020년 2월 27일 이전에 샘플한 바이러스 유전체를 분석한 결과, 코로나-19 대유행 초기 한국의 재생산수는 1보다 크다는 것을 밝혔으며 이는 당시 한국의 코로나-19 확진자 수는 급격히 증가했던 사실과 일치한다.
#Bayesian inference #COVID-19 #genomic epidemiology #Markov chain Monte Carlo #SARS-CoV-2

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참고문헌 (37)

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Abutaleb Y, Gearan A, and Wagner J. 2020. Coronavirus could roar back if states lift restrictions too soon, top U.S. health officials warn. https://www.washingtonpost.com/national/coronavirus-warning-outbreaks-school/2020/05/12/17bf62d6-946a-11ea-82b4-c8db161ff6e5_story.html (Accessed July 13, 2020). Andersen KG, Rambaut A, Lipkin WI, Holmes EC, and Garry RF. 2020. The proximal origin of SARS-CoV-2. Nat. Med. 26, 450?452. google schola Ayittey FK, Ayittey MK, Chiwero NB, Kamasah JS, and Dzuvor C. 2020. Economic impacts of Wuhan 2019-nCoV on China and the world. J. Med. Virol. 92, 473?475. google schola Bao Y, Sun Y, Meng S, Shi J, and Lu L. 2020. 2019-nCoV epidemic: address mental health care to empower society. Lancet 395, e37? e38. google schola Boskova V, Bonhoeffer S, and Stadler T. 2014. Inference of epidemiological dynamics based on simulated phylogenies using birth-death and coalescent models. PLoS Comput. Biol. 10, e1003913. google schola

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