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학술저널
저자정보
Lee, Soo Youn (Seoul National University Biomedical Informatics [SNUBI] and Systems Biomedical Informatics Research Center) Kim, Ju Han (Seoul National University Biomedical Informatics [SNUBI] and Systems Biomedical Informatics Research Center)
저널정보
대한의학유전학회 Journal of genetic medicine Journal of genetic medicine 제10권 제1호
발행연도
2013.1
수록면
27 - 32 (6page)

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Post-transcriptional nucleotide sequence modification of transcripts by RNA editing is an important molecular mechanism in the regulation of protein function and is associated with a variety of human disease phenotypes. Identification of RNA editing sites is the basic step for studying RNA editing. Databases and bioinformatics resources are used to annotate and evaluate as well as identify RNA editing sites. No method is free of limitations. Correctly establishing an analytic pipeline and strategic application of both experimental and bioinformatics methods constitute the first step in investigating RNA editing. This review summarizes modern bioinformatics approaches and related resources for RNA editing research.
#RNA editing #RNA-Seq #Bioinformatics

목차

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Park E / 2012 / RNA editing in the human ENCODE RNA-seq data / Genome Res 22:1626~1633 google schola Kleinman CL / 2012 / Comment on "Widespread RNA and DNA sequence differences in the human transcriptome / Science 335:1302~1302 google schola Lin W / 2012 / Comment on "Widespread RNA and DNA sequence differences in the human transcriptome / Science 335:1302~1302 google schola Pickrell JK / 2012 / Comment on "Widespread RNA and DNA sequence differences in the human transcriptome / Science 335:1302 google schola Benne R / 1986 / Major transcript of the frameshifted coxII gene from trypanosome mitochondria contains four nucleotides that are not encoded in the DNA / Cell 46:819~826 google schola

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