Regulation of DNAzyme function by hypoxic irradiation that induces one-electron reduction of 2-oxoalkyl group on thymine base

Kanezaki, Hiroshi; Nishimoto, Sei-Ichi; Tanabe, Kazuhito

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자료유형: 학술저널

저자정보: Kanezaki, Hiroshi (Department of Energy and Hydrocarbon Chemistry, Graduate School of Engineering, Kyoto University) Nishimoto, Sei-Ichi (Department of Energy and Hydrocarbon Chemistry, Graduate School of Engineering, Kyoto University) Tanabe, Kazuhito (Department of Energy and Hydrocarbon Chemistry, Graduate School of Engineering, Kyoto University)

저널정보: 한국광과학회 Rapid communication in photoscience : RCP Rapid communication in photoscience : RCP 제3권 제4호

발행연도: 2014.1

수록면: 79 - 80 (2page)

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We characterized the one-electron reduction of oligodeoxynucleotides with a 2-oxopropyl group on a thymine base ($d^{oxo}T$) and applied the reaction to the radiolytic activation of DNAzyme function. We designed a system in which the DNAzyme function of cleaving mRNA was suppressed by introduction of $d^{oxo}T$ into the strand of DNAzyme. Hypoxic X-irradiation led to recovery of the cleavage ability because the 2-oxopropyl group was removed to form unmodified DNAzyme. We characterized the DNAzyme function by monitoring the fluorescence change of fluorophore- and quencher-labeled target strands. We confirmed that the DNAzyme function could be regulated by hypoxic X-irradiation and the reaction of $d^{oxo}T$.

#X-irradiation #DNAzyme #Artificial oligonucleotides

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Kanezaki, Hiroshi

소속기관 Department of Energy and Hydrocarbon Chemistry, Graduate School of Engineering, Kyoto University

주요연구분야 자연과학 > 물리학

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Nishimoto, Sei-Ichi

소속기관 Department of Energy and Hydrocarbon Chemistry, Graduate School of Engineering, Kyoto University

주요연구분야 자연과학 > 물리학

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Tanabe, Kazuhito

소속기관 Department of Energy and Hydrocarbon Chemistry, Graduate School of Engineering, Kyoto University

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