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자료유형
학술저널
저자정보
Kim, Sang-Ki (Department of Biology, Teachers College and Institute for Phylogenomics and Evolution, Kyungpook National University) Kim, Ji-Jung (Department of Life Sciences, Yeungnam University) Ryu, Shi-Hyun (Department of Biology, Teachers College and Institute for Phylogenomics and Evolution, Kyungpook National University) Suk, Ho-Young (Department of Life Sciences, Yeungnam University) Hwang, Ui-Wook (Department of Biology, Teachers College and Institute for Phylogenomics and Evolution, Kyungpook National University)
저널정보
한국통합생물학회 Animal cells and systems Animal cells and systems 제16권 제3호
발행연도
2012.1
수록면
224 - 229 (6page)

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The Korean shiner (Coreoleuciscus splendidus, Gobioninae), a small freshwater fish native to Korea Peninsula, widely inhabits in most of the major drainages in South Korea. Here we describe the development of 14 novel and polymorphic microsatellites for this species and its effective utilization in estimation of genetic diversity using 72 individuals from three sampling sites in different drainages. Loci were isolated from a microsatellite enrichment procedure using probe-labeled magnetic beads. A total of 242 alleles were detected across all loci with an average of 17.3 alleles per locus ranging 4 32. The loci varied levels of polymorphism as evident from its expecte heterozygosity ranging from 0.111 to 0.957. The average pairwise $F_{ST}$ between two populations examined shows significant differentiation ($F_{ST}$ = 0.215, p<0.05). The 14 microsatellite loci developed here will also be useful to explain for the genetic structures among geographically isolated populations and gene flow dynamics within drainages in this species as well as the closely related species.
#microsatellites #Korean shiner #Coreoleuciscus splendidus #molecular markers #Gobioninae

목차

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참고문헌 (21)

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안혜숙 / 2010 / Comparative genetic diversity of wild and released populations of Pacific abalone Haliotis discus discus in Jeju, Korea, based on cross-species microsatellite markers including two novel loci / Animal Cells and Systems 14(4):305~313 google schola S. Bhatia / 2007 / Genetic Characterization and Differentiation of Indian Sheep Breeds Using Microsatellite Marker Information / Genes & Genomics 29(3):297~306 dbpia Bos DH / 2008 / Inferring population history and demography using microsatellites, mitochondrial DNA, and major histocompatibility complex(MHC)genes / Evolution 62:1458~1468 google schola Choi KC / 1990 / On the microdistribution of fresh-water fish, Coreoleuciscus splendidus (Gobioninae) from Korea / Korean J Ichthyol 2:63~76 google schola Domı´nguez-Domı´nguez O / 2008 / Evolutionary history of the endangered fish Zoogoneticus quitzeoensis(Bean, 1898)(Cyprinodontiformes : Goodeidae)using a sequential approach to phylogeography based on mitochondrial and nuclear DNA data / BMC Evol Biol 8:161 google schola

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