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학술저널
저자정보
Detry, Nicolas (Department of Forest Sciences, University of Helsinki) Choi, Jaeyoung (Fungal Bioinformatics Laboratory, Center for Fungal Pathogenesis, and Department of Agricultural Biotechnology, Seoul National University) Kuo, Hsiao-Che (Department of Forest Sciences, University of Helsinki) Asiegbu, Fred O. (Department of Forest Sciences, University of Helsinki) Lee, Yong-Hwan (Department of Forest Sciences, University of Helsinki)
저널정보
한국균학회 Mycobiology Mycobiology 제42권 제3호
발행연도
2014.1
수록면
241 - 248 (8page)

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NADPH oxidases (Noxes), transmembrane proteins found in most eukaryotic species, generate reactive oxygen species and are thereby involved in essential biological processes. However, the fact that genes encoding ferric reductases and ferric-chelate reductases share high sequence similarities and domains with Nox genes represents a challenge for bioinformatic approaches used to identify Nox-encoding genes. Further, most studies on fungal Nox genes have focused mainly on functionality, rather than sequence properties, and consequently clear differentiation among the various Nox isoforms has not been achieved. We conducted an extensive sequence analysis to identify putative Nox genes among 34 eukaryotes, including 28 fungal genomes and one Oomycota genome. Analyses were performed with respect to phylogeny, transmembrane helices, di-histidine distance and glycosylation. Our analyses indicate that the sequence properties of fungal Nox genes are different from those of human and plant Nox genes, thus providing novel insight that will enable more accurate identification and characterization of fungal Nox genes.
#Nox #Fungal genome #NADPH oxidase #Phylogenetics #ROS

목차

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참고문헌 (27)

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Bedard K / 2007 / The NOX family of ROS-generating NADPH oxidases: physiology and pathophysiology / Physiol Rev 87:245~313 google schola Sumimoto H / 2008 / Structure, regulation and evolution of Noxfamily NADPH oxidases that produce reactive oxygen species / FEBS J 275:3249~3277 google schola Suzuki N / 2011 / Respiratory burst oxidases: the engine of ROS signaling / Curr Opin Plant Biol 14:691~699 google schola Heller J / 2011 / Reactive oxygen species in phytopathogenic fungi: signaling, development, and disease / Annu Rev Phytopathol 49:369~390 google schola Scott B / 2008 / Role of reactive oxygen species in fungal cellular differentiations / Curr Opin Microbiol 11:488~493 google schola

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