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자료유형
학술저널
저자정보
Lee, Kyung-Eun (Department of Computer Science, Ewha Womans University) Jang, Myung-Ha (Department of Computer Science, Ewha Womans University) Rhie, A-Rang (Department of Computer Science, Ewha Womans University) Thong, Chin Ting (Department of Computer Science, Ewha Womans University) Yang, San-Duk (Department of Computer Science, Ewha Womans University) Park, Hyun-Seok (Department of Computer Science, Ewha Womans University)
저널정보
한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제8권 제2호
발행연도
2010.1
수록면
94 - 96 (3page)

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Integrating various pathway data collections to create new biological knowledge is a challenge, for which novel computational tools play a key role. For this purpose, we developed the Java-based conversion modules KGML2SBML and KGML2BioPAX to translate KGML (KEGG Markup Language) into a couple of common data exchange formats: SBML (Systems Biology Markup Language) and BioPAX (Biological Pathway Exchange). We hope that our work will be beneficial for other Java developers when they extend their bioinformatics system into SBML- or BioPAX-aware analysis tools. This is part of our ongoing effort to develop an ultimate KEGG-based pathway enrichment analysis system.
#systems biology #visualization #common exchange format

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