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학술저널
저자정보
Keam, Bhum-Suk (Department of Internal Medicine, Seoul National University Hospital) Hwang, Joo-Yeon (Center for Genome Science, National Institute of Health, Osong Health Technology Administration Complex) Go, Min-Jin (Center for Genome Science, National Institute of Health, Osong Health Technology Administration Complex) Heo, Jee-Yeon (Center for Genome Science, National Institute of Health, Osong Health Technology Administration Complex) Park, Mi-Sun (Center for Genome Science, National Institute of Health, Osong Health Technology Administration Complex) Lee, Ji-Young (Center for Genome Science, National Institute of Health, Osong Health Technology Administration Complex) Kim, Nam-Hee (Center for Genome Science, National Institute of Health, Osong Health Technology Administration Complex) Park, Miey (Center for Genome Science, National Institute of Health, Osong Health Technology Administration Complex) Oh, Ji-Hee (Center for Genome Science, National Institute of Health, Osong Health Technology Administration Complex) Kim, Dong-Hyun (Department of Social and Preventive Medicine, College of Medicine, Hallym Universi) Jeong, Jin-Young Lee, Jong-Young Han, Bok-Ghee Lee, Ju-Young
저널정보
한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제9권 제3호
발행연도
2011.1
수록면
121 - 126 (6page)

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Osteoarthritis (OA) is the most common degenerative joint disorder in the elderly population. To identify OA-associated genetic variants and candidate genes, we conducted a genome-wide association study (GWAS). A total 3,793 samples (476 cases: wrist + knee and 3317 controls) from a community-based epidemiological study were genotyped using the Affymetrix SNP 5.0. An intronic SNP (rs4789934) in the TIMP2 (tissue inhibitor of metalloproteinase-2) showed the most significance with OA (odd ratio [OR] = 2.06, 95% confidence interval [CI] = 1.52-2.81, p = $4.01{\times}10^{-6}$). Furthermore, a poly-morphism (rs1352677) in the NKAIN2 ($Na^+/K^+$ transporting ATPase interacting 2) was suggestively associated with OA (OR = 1.43, CI = 1.22-1.66, p = $7.01{\times}10^{-6}$). The present study provides new insights into the identification of genetic predisposing factors for OA.
#genome-wide association study #osteoarthritis #polymorphism #TIMP2

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참고문헌 (35)

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Abel, K. / 2006 / Genome-wide SNP association: identification of susceptibility alleles for osteoarthritis / Autoimmun. Rev 5:258~263 google schola Cawston, T / 1998 / Matrix metalloproteinases and TIMPs: properties and implications for the rheumatic diseases / Mol. Med. Today 4:130~137 google schola Cho, N / 2006 / Relation of habitual snoring with components of metabolic syndrome in Korean adults / Diabetes Res. Clin Pract 71:256~263 google schola Cho, Y.S. / 2009 / A large-scale genome-wide association study of Asian populations uncovers genetic factors influencing eight quantitative traits / Nat. Genet 41:527~534 google schola Clayton, D.G / 2005 / Population structure, differential bias and genomic control in a large-scale, case-control association study / Nat. Genet 37:1243~1246 google schola

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