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자료유형
학술저널
저자정보
Sarda, Shrutii (Center for Bioinformatics and Computational Biology, University of Maryland, College Park) Hannenhalli, Sridhar (Center for Bioinformatics and Computational Biology, University of Maryland, College Park)
저널정보
한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제12권 제1호
발행연도
2014.1
수록면
2 - 11 (10page)

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After the initial enthusiasm of the human genome project, it became clear that without additional data pertaining to the epigenome, i.e., how the genome is marked at specific developmental periods, in different tissues, as well as across individuals and species-the promise of the genome sequencing project in understanding biology cannot be fulfilled. This realization prompted several large-scale efforts to map the epigenome, most notably the Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) project. While there is essentially a single genome in an individual, there are hundreds of epigenomes, corresponding to various types of epigenomic marks at different developmental times and in multiple tissue types. Unprecedented advances in next-generation sequencing (NGS) technologies, by virtue of low cost and high speeds that continue to improve at a rate beyond what is anticipated by Moore's law for computer hardware technologies, have revolutionized molecular biology and genetics research, and have in turn prompted innovative ways to reduce the problem of measuring cellular events involving DNA or RNA into a sequencing problem. In this article, we provide a brief overview of the epigenome, the various types of epigenomic data afforded by NGS, and some of the novel discoveries yielded by the epigenomics projects. We also provide ample references for the reader to get in-depth information on these topics.
#chromatin accessibility #epigenomics #methylation #next-generation sequencing #regulation

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U.S. Department of Health and Human Services / International Consortium Announces the 1000 Genomes Project google schola Maurano MT / 2012 / Systematic localization of common disease-associated variation in regulatory DNA / Science 337:1190~1195 google schola King MC / 1975 / Evolution at two levels in humans and chimpanzees / Science 188:107~116 google schola Inbar-Feigenberg M / 2013 / Basic concepts of epigenetics / Fertil Steril 99:607~615 google schola Baker M / 2011 / Genomics: Genomes in three dimensions / Nature 470:289~294 google schola

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