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자료유형
학술저널
저자정보
Kim, Min-Soo (Department of Life and Nanopharmaceutical Science and Department of Biology, Kyung Hee University) Whon, Tae Woong (Department of Life and Nanopharmaceutical Science and Department of Biology, Kyung Hee University) Bae, Jin-Woo (Department of Life and Nanopharmaceutical Science and Department of Biology, Kyung Hee University)
저널정보
한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제11권 제3호
발행연도
2013.1
수록면
121 - 128 (8page)

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The introduction of metagenomics into the field of virology has facilitated the exploration of viral communities in various natural habitats. Understanding the viral ecology of a variety of sample types throughout the biosphere is important per se, but it also has potential applications in clinical and diagnostic virology. However, the procedures used by viral metagenomics may produce technical errors, such as amplification bias, while public viral databases are very limited, which may hamper the determination of the viral diversity in samples. This review considers the current state of viral metagenomics, based on examples from Korean viral metagenomic studies-i.e., rice paddy soil, fermented foods, human gut, seawater, and the near-surface atmosphere. Viral metagenomics has become widespread due to various methodological developments, and much attention has been focused on studies that consider the intrinsic role of viruses that interact with their hosts.
#bacteriophages #DNA sequence analysis #DNA viruses #environment #metagenomics

목차

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Mokili JL / 2012 / Metagenomics and future perspectives in virus discovery / Curr Opin Virol 2:63~77 google schola Rohwer F / 2009 / Roles of viruses in the environment / Environ Microbiol 11:2771~2774 google schola Willner D / 2013 / From deep sequencing to viral tagging: recent advances in viral metagenomics / Bioessays 35:436~442 google schola Rohwer F / 2002 / The Phage Proteomic Tree: a genome- based taxonomy for phage / J Bacteriol 184:4529~4535 google schola Rosario K / 2011 / Exploring the viral world through metagenomics / Curr Opin Virol 1:289~297 google schola

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