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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
Kim, Byung-Dong (Department of Plant Science, Seoul National University)
저널정보
한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제12권 제3호
발행연도
2014.1
수록면
80 - 86 (7page)

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Foldback intercoil (FBI) DNA is formed by the folding back at one point of a non-helical parallel track of double-stranded DNA at as sharp as $180^{\circ}$ and the intertwining of two double helixes within each other's major groove to form an intercoil with a diameter of 2.2 nm. FBI DNA has been suggested to mediate intra-molecular homologous recombination of a deletion and inversion. Inter-molecular homologous recombination, known as site-specific insertion, on the other hand, is mediated by the direct perpendicular approach of the FBI DNA tip, as the attP site, onto the target DNA, as the attB site. Transposition of DNA transposons involves the pairing of terminal inverted repeats and 5-7-bp tandem target duplication. FBI DNA configuration effectively explains simple as well as replicative transposition, along with the involvement of an enhancer element. The majority of diverse retrotransposable elements that employ a target site duplication mechanism is also suggested to follow the FBI DNA-mediated perpendicular insertion of the paired intercoil ends by non-homologous end-joining, together with gap filling. A genome-wide perspective of transposable elements in light of FBI DNA is discussed.
#DNA end-joining repair #DNA transposable elements #foldback intercoil DNA #homologous recombination #retroelements #target site duplication

목차

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