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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
Jeong, Hyun-hwan (Department of Information and Computer Engineering, Ajou University) Sohn, Kyung-Ah (Department of Information and Computer Engineering, Ajou University)
저널정보
한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제12권 제4호
발행연도
2014.1
수록면
216 - 224 (9page)

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Gastritis is a common but a serious disease with a potential risk of developing carcinoma. Helicobacter pylori infection is reported as the most common cause of gastritis, but other genetic and genomic factors exist, especially single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Association studies between SNPs and gastritis disease are important, but results on epistatic interactions from multiple SNPs are rarely found in previous genome-wide association (GWA) studies. In this study, we performed computational GWA case-control studies for gastritis in Korea Associated Resource (KARE) data. By transforming the resulting SNP epistasis network into a gene-gene epistasis network, we also identified potential gene-gene interaction factors that affect the susceptibility to gastritis.
#gastritis #genome-wide association study #KARE #mutual information #relevance network #single-nucleotide polymorphism

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참고문헌 (30)

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박경식 / 2011 / 소화기질환이 유발하는 사회ㆍ경제적 손실 정도는? / 대한소화기학회지 58(6):297~299 google schola Corvalan AH / 2013 / Current Topics in Gastritis / InTech :79~95 google schola Marshall BJ / 1984 / Unidentified curved bacilli in the stomach of patients with gastritis and peptic ulceration / Lancet 1:1311~1315 google schola Lee HW / 2009 / Association of the human leukocyte antigen class II alleles with chronic atrophic gastritis and gastric carcinoma in Koreans / J Dig Dis 10:265~271 google schola Yuzhalin A / 2011 / The role of interleukin DNA polymorphisms in gastric cancer / Hum Immunol 72:1128~1136 google schola

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