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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
정현철 (광주보건대 병원전산관리과) 박병전 (조선대학교 컴퓨터통계학과) 배상현 (조선대학교 컴퓨터통계학과)
저널정보
조선대학교 기초과학연구원 조선자연과학논문집 조선자연과학논문집 제2권 제4호
발행연도
2009.1
수록면
243 - 251 (9page)

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This paper surveys some researches to accomplish on bioinformatics. These researches wish to propose a database architecture combining a general view of bioinformatics data as a graph of data objects and data relationships, with the efficiency and robustness of data management and query provided by indexing and generic programming techniques. Here, these invert the role of the index, and make it a first-class citizen in the query language. It is possible to do this in a structured way, allowing users to mention indexes explicitly without yielding to a procedural query model, by converting functional relations into explicit functions. In the limit, the database becomes a graph, in which the edges are these indexes. Function composition can be specified either explicitly or implicitly as path queries. The net effect of the inversion is to convert the database into a hyperdatabase: a database of databases, connected by indexes or functions. The inversion approach was motivated by their work in biological databases, for which hyperdatabases are a good model. The need for a good model has slowed progress in bioinformatics.
#Bioinformatics #Database #Genetic #Programming

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