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저자정보
권운혁 (제물포고등학교) 박혁 (제물포고등학교) 백민재 (제물포고등학교) 조우진 (제물포고등학교) 최우정 (제물포고등학교) 안치범 (제물포고등학교) 신도빈 (인천대학교 생명과학부) 이태수 (인천대학교 생명과학부)
저널정보
한국버섯학회 한국버섯학회지 한국버섯학회지 제11권 제2호
발행연도
2013.1
수록면
69 - 76 (8page)

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우리나라와 전 세계의 여러 지역에서 수집한 비늘버섯속 18 균주와 개암비늘버섯 2 균주를 대상으로 rDNA의 ITS region 염기서열과 genomic DNA의 RAPD-PCR을 수행하였다. ITS1과 ITS2영역의 염기의 수는 각각 233~271, 158~233 그리고 174~219 염기쌍으로 종에 따라 변이가 있었는데 ITS2영역의 염기서열이 ITS1의 영역보다 변이가 높았고 5.8S지역의염기의수는 비교적 변이가 적었다. 각각의 균주 간 유연관계를 알아보기 위해 ITS영역의 염기서열을 이용하여 계통도를 작성한 결과 실험에 사용한 균주는 8개의 클러스터로 나누어지는 것으로 나타났으며 동일한 종의 버섯은 동일한 클러스터에 속하는 것으로 나타났다. 또한 20종류의 primer를 이용하여 비늘버섯속 버섯을 대상으로 RAPD-PCR을 수행한 결과 15개의 primer가 효과적으로 염색체 DNA를 증폭하는 것으로 나타났다. 증폭의 양상은 primer의 종류와 종에 따라 변이가 있었다. 이 결과를 토대로 계통수를 작성한 결과 계통수는 ITS 영역의 PCR 결과와 매우 유사하였다. 본 실험결과, 실험에 사용한 비늘버섯속 버섯의 종과 계통 간의 유연관계는 높았으며, rDNA ITS 영역의 염기서열분석 결과를 이용해 공시된 각각의 비늘버섯 종을 분류하는데 유용하게 사용이 가능하였다.
#PCR #Pholiota species #Phylogeny #Polymorphism

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참고문헌 (13)

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Nuhu Alam / 2009 / Phylogenetic Relationship in Different Commercial Strains of Pleurotus nebrodensis Based on ITS Sequence and RAPD / Mycobiology 37(3):183~188 google schola Nuhu Alam / 2009 / Vegetative Growth and Phylogenetic Relationship of Commercially Cultivated Strains of Pleurotus eryngii based on ITS sequence and RAPD / Mycobiology 37(4):258~266 google schola Caetano, A. G. / 1997 / DNA markers: Protocols Applications, and Overviews / Wiley-Vch :364 google schola Cubero, O. F / 1999 / DNA extraction and PCR amplification method suitable for fresh, herbarium-stored, lichenized, and other fungi / Plant Syst. Evol 216:243~249 google schola Felsenstein, J. / 1985 / Confidence limits on phylogenies: and approach using the bootstrap / Evol 39:789~791 google schola

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