A Probabilistic Approach to the Assessment of Phylogenetic Conservation in Mammalian Hox Gene Clusters

Stojanovic, Nikola; Dewar, Ken

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자료유형: 학술대회자료

저자정보: Stojanovic, Nikola (Department of Computer Science and Engineering, University of Texas at Arlington) Dewar, Ken (Department of Human Genetics, McGill University, Genome Quebec Innovation Centre, Montreal)

저널정보: 한국생물정보시스템생물학회 한국생물정보시스템생물학회 학술대회 한국생물정보시스템생물학회 2005년도 BIOINFO 2005

발행연도: 2005.1

수록면: 118 - 123 (6page)

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With the increasing availability of mammalian genome sequences it became possible to use large scale phylogenetic analysis in order to locate potentially functional regions. In this paper we describe a new probabilistic method for the characterization of phylogenetic conservation in mammalian DNA sequences. We have used this method for the analysis of Hox gene clusters, based on the alignment of 6 species, and we constructed a map of for indicating short and long conserved fragments and their positions with respect to the known locations of Hox genes and other elements, sometimes showing surprising layouts.

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Stojanovic, Nikola

소속기관 Department of Computer Science and Engineering, University of Texas at Arlington

주요연구분야 자연과학 > 생물학

논문수 1 이용수 0

Dewar, Ken

소속기관 Department of Human Genetics, McGill University, Genome Quebec Innovation Centre, Montreal

주요연구분야 자연과학 > 생물학

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