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학술대회자료
저자정보
Lee, In-Bok (School of Computer Science and Engineering, Seoul National University) Park, Kun-Soo (School of Computer Science and Engineering, Seoul National University)
저널정보
한국생물정보시스템생물학회 한국생물정보시스템생물학회 학술대회 한국생물정보시스템생물학회 2003년도 제2차 연례학술대회 발표논문집
발행연도
2003.1
수록면
193 - 199 (7page)

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The application of finding occurrences of a pattern that contains gaps includes information retrieval, data mining, and computational biology. As the biological sequences may contain errors, it is important to find not only the exact occurrences of a pattern but also approximate ones. In this paper we present an O(mnk$_{max}$/w) time algorithm for the approximate gapped pattern matching problem, where m is the length of the text, H is the length of the pattern, w is the word size of the target machine, and k$_{max}$ is the greatest error bound for subpatterns.

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