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Seung-Hyeon Choi (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Ji-Sun Kim (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Jam-Eon Park (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Byeong Seob Oh (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seoung Woo Ryu (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung Yeob Yu (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Se Won Kang (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Kook-Il Han (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Min Kuk Suh (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Han Sol Kim (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Keun Chul Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Mi Kyung Eom (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Dong Ho Lee (Seoul National University Bundang Hospital) Hyuk Yoon (Seoul National University Bundang Hospital) Byung-Yong Kim (ChunLab) Je Hee Lee (ChunLab) Ju Huck Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Jung-Sook Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung-Hwan Park (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology)
저널정보
한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 제55권 제4호
발행연도
2019.12
수록면
411 - 414 (4page)

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Anaerotigum 속 균주들은 메탄 생성 반응기, 검은 진흙, 무산소 소화조 슬러지, 닭의 맹장, 인간 분변 등에서 분리된 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 건강한 한국인 분변으로부터 Anaerotigum faecicola KGMB03357 균주를 분리하였으며 PacBio Sequel 플랫폼을 이용하여 Anaerotigum faecicola KGMB03357 균주의 유전체서열을 분석하였다. 유전체는 DNA G + C 구성 비율이 47.3 mol%이고, 2,357개의 유전자와 rRNA 28개, tRNA 74개로 구성되었으며, 염색체의 크기는 2,520,658 bp였다. 또한, 유전체 분석 결과를 통해 아미노산 생합성 그리고 항생제 내성과 관련된 다양한 유전자를 발견하였다.
#Anaerotinum faecicola #draft genome sequence #human faeces #PacBio Sequel

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Bolan S / 2016 / Bio‐banking gut microbiome samples / EMBO Rep 17:929~930 google schola Kanehisa M / 2014 / Data, information, knowledge and principle : back to metabolism in KEGG / Nucleic Acids Res 42:D199~205 google schola Kau AL / 2011 / Human nutrition, the gut microbiome and the immune system / Nature 474:327~336 google schola Lee I / 2017 / ContEst16S: an algorithm that identifies contaminated prokaryotic genomes using 16S RNA gene sequences / Int. J. Syst. Evol. Microbiol 67:2053~2057 google schola Lee I / 2016 / OrthoANI : An improved algorithm and software for calculating average nucleotide identity / Int. J. Syst. Evol. Microbiol 66:1100~1103 google schola

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