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한국, 몽골, 러시아, 중국 북반부에 서식하는 진달래는 예로부터 약재뿐 만이 아니라 관광 자원으로써도 잘 알려져 왔다. 이중 한국의 대구에 위치한 비슬산 군립공원 또한 진달래 관광지로 유명하다. 이러한 환경에서 진달래와 흙에 존재하는 미생물 군집 간의 관계를 조사하기 위해서, 2월과 8월에 걸쳐 군립공원 내 3 곳을 선택하여 실험을 진행하였다. 박테리아 군집 조사를 위해 확보된 흙들은 pyrosequencing 과정을 거쳤으며 총 404,899개의 sequencing reads를 확보하였다. 두 날씨에 따라 각기 다른 3 곳의 채집 장소로부터 operational taxonomic units (OTUs) 값이 측정되었으며 이는 2,349에서 4,736 수치를 보였다. OTUs 값 측정결과 채집 장소 중에서는 군립공원입구 지역에서 가장 높은 값을 보였으며 계절로는 8월이 2월보다 높은 수치를 보였다. 반면 가장 낮은 수치의 OTUs 값을 보인 샘플은 제 2 관측지점, 특히 2월에 채집한 흙이었다. 또한 Chao1과 Sannon index 값 측정 결과, 8월에 채집한 군립공원 입구에서 유래한 샘플에서 가장 높은 생물 풍부도와 다양성 수치를 보였다. 연구를 통해, 6 샘플로부터 유래한 박테리아 군집은 비슬산 군립공원에서만 발견되는 45개의 속과 287개의 종으로 구성된 공통의 조성을 보였다. 이 발견된 공통 박테리아들은 진달래 군집 생성에 영향을 끼칠 것으로 기대되고 있다.
목차
Introduction
Materials and Methods
Results
Discussion
References
초록
참고문헌 (23)
참고문헌 신청
Aslam, Z., Lee, C. S., Kim, K. H., Im, W. T., Ten, L. N. and Lee, S. T. 2007. Methylobacterium jeotgali sp. nov., a nonpigmented, facultatively methylotrophic bacterium isolated from jeotgal, a traditional Korean germented seafood. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57, 566-571.
Balvo?i?t?, M. and Huson, D. H. 2017. SILVA, RDP, Greengenes, NCBI and OTT - how do these taxonomies compare. BMC Genomics 18, 114.
Caro-Quintero, A. and Konstantinidis, K. T. 2012. Bacterial species may exist, metagenomics reveal. Environ. Microbiol. 14, 347-355.
Castelino, M., Eyre, S., Moat, J., Fox, G., Martin, P., Ho, P., Upton, M. and Barton, A. 2017. Optimisation of methods for bacterial skin microbiome investigation: primer selection and comparison of the 454 versus MiSeq platform. BMC Microbiol. 17, 23.
Chun, J., Kim, K. Y., Lee, J. H. and Choi, Y. 2010. The analysis of oral microbial communities of wild-type and toll-like receptor 2-deficient mice using a 454 GS FLX Titanium pyrosequencer. BMC Microbiol. 10, 101.
Balvo?i?t?, M. and Huson, D. H. 2017. SILVA, RDP, Greengenes, NCBI and OTT - how do these taxonomies compare. BMC Genomics 18, 114.
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Castelino, M., Eyre, S., Moat, J., Fox, G., Martin, P., Ho, P., Upton, M. and Barton, A. 2017. Optimisation of methods for bacterial skin microbiome investigation: primer selection and comparison of the 454 versus MiSeq platform. BMC Microbiol. 17, 23.
Chun, J., Kim, K. Y., Lee, J. H. and Choi, Y. 2010. The analysis of oral microbial communities of wild-type and toll-like receptor 2-deficient mice using a 454 GS FLX Titanium pyrosequencer. BMC Microbiol. 10, 101.
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